RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 AKNAQ7Z591 1439 aa36.71■■■■□ 3.47
GLI3-202ENST00000428534 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.68■■■■□ 3.46
GLI3-202ENST00000428534 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.67■■■■□ 3.46
GLI3-202ENST00000428534 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
GLI3-202ENST00000428534 PREX2Q70Z35 1606 aa36.63■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.62■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 NCOA2Q15596 1464 aa36.57■■■■□ 3.45
GLI3-202ENST00000428534 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.56■■■■□ 3.44
GLI3-202ENST00000428534 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.56■■■■□ 3.44
GLI3-202ENST00000428534 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.53■■■■□ 3.44
GLI3-202ENST00000428534 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.51■■■■□ 3.44
GLI3-202ENST00000428534 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.5■■■■□ 3.43
GLI3-202ENST00000428534 RAPGEF3O95398 923 aa36.5■■■■□ 3.43
GLI3-202ENST00000428534 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
GLI3-202ENST00000428534 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.47■■■■□ 3.43
GLI3-202ENST00000428534 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.42■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.41■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.41■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 ABCC1P33527 1531 aa36.39■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.39■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 RICTORQ6R327 1708 aa36.39■■■■□ 3.42
GLI3-202ENST00000428534 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.37■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 MIA2Q96PC5 1412 aa36.35■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.35■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.34■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.34■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
GLI3-202ENST00000428534 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.32■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.31■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 AFAP1Q8N556 730 aa36.3■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.28■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.28■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 PTPRMP28827 1452 aa36.27■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.26■■■■□ 3.4
GLI3-202ENST00000428534 KDM5CP41229 1560 aa36.26■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.25■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 MADDQ8WXG6 1647 aa36.24■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.24■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.22■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.22■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.21■■■■□ 3.39
GLI3-202ENST00000428534 MBD5Q9P267 1494 aa36.18■■■■□ 3.38
GLI3-202ENST00000428534 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
GLI3-202ENST00000428534 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
GLI3-202ENST00000428534 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.14■■■■□ 3.38
GLI3-202ENST00000428534 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.14■■■■□ 3.38
GLI3-202ENST00000428534 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 TSPY4P0CV99 314 aa36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 TSPY10P0CW01 314 aa36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 ATP10AO60312 1499 aa36.11■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.1■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.08■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.08■■■■□ 3.37
GLI3-202ENST00000428534 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.06■■■■□ 3.36
GLI3-202ENST00000428534 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
GLI3-202ENST00000428534 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
GLI3-202ENST00000428534 ATP7AQ04656 1500 aa36.02■■■■□ 3.36
GLI3-202ENST00000428534 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36■■■■□ 3.35
GLI3-202ENST00000428534 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
GLI3-202ENST00000428534 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.98■■■■□ 3.35
GLI3-202ENST00000428534 REREQ9P2R6 1566 aa35.98■■■■□ 3.35
GLI3-202ENST00000428534 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.97■■■■□ 3.35
GLI3-202ENST00000428534 ABCA6Q8N139 1617 aa35.94■■■■□ 3.34
GLI3-202ENST00000428534 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
GLI3-202ENST00000428534 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.9■■■■□ 3.34
GLI3-202ENST00000428534 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.89■■■■□ 3.34
GLI3-202ENST00000428534 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
GLI3-202ENST00000428534 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.88■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 DAPK1P53355 1430 aa35.87■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 AGLP35573 1532 aa35.87■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 ABCC5O15440 1437 aa35.86■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 A2MP01023 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.84■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 MLECQ14165 292 aa35.84■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.83■■■■□ 3.33
GLI3-202ENST00000428534 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
GLI3-202ENST00000428534 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
GLI3-202ENST00000428534 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.77■■■■□ 3.32
GLI3-202ENST00000428534 PLXNC1O60486 1568 aa35.75■■■■□ 3.31
GLI3-202ENST00000428534 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.75■■■■□ 3.31
GLI3-202ENST00000428534 HSPA2P54652 639 aa35.73■■■■□ 3.31
GLI3-202ENST00000428534 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GLI3-202ENST00000428534 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.69■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.68■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 FBXO41Q8TF61 875 aa35.67■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.67■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 KIF15Q9NS87 1388 aa35.66■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 ADGRL2O95490 1459 aa35.66■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.64■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 NCOA1Q15788 1441 aa35.64■■■■□ 3.3
GLI3-202ENST00000428534 KIF3BO15066 747 aa35.63■■■■□ 3.29
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