RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.4■■■■■ 4.86
TRIOBP-209ENST00000428075 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.38■■■■■ 4.86
TRIOBP-209ENST00000428075 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.38■■■■■ 4.85
TRIOBP-209ENST00000428075 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.36■■■■■ 4.85
TRIOBP-209ENST00000428075 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
TRIOBP-209ENST00000428075 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa45.34■■■■■ 4.85
TRIOBP-209ENST00000428075 MAGI2Q86UL8 1455 aa45.33■■■■■ 4.85
TRIOBP-209ENST00000428075 PTPRMP28827 1452 aa45.3■■■■■ 4.84
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.3■■■■■ 4.84
TRIOBP-209ENST00000428075 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.29■■■■■ 4.84
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa45.26■■■■■ 4.84
TRIOBP-209ENST00000428075 MADDQ8WXG6 1647 aa45.26■■■■■ 4.84
TRIOBP-209ENST00000428075 PREX2Q70Z35 1606 aa45.18■■■■■ 4.82
TRIOBP-209ENST00000428075 AFAP1Q8N556 730 aa45.17■■■■■ 4.82
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa45.15■■■■■ 4.82
TRIOBP-209ENST00000428075 KDM5CP41229 1560 aa45.13■■■■■ 4.82
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP10AO60312 1499 aa45.11■■■■■ 4.81
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.09■■■■■ 4.81
TRIOBP-209ENST00000428075 CEP162Q5TB80 1403 aa45.09■■■■■ 4.81
TRIOBP-209ENST00000428075 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCC1P33527 1531 aa45.06■■■■■ 4.8
TRIOBP-209ENST00000428075 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.04■■■■■ 4.8
TRIOBP-209ENST00000428075 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.04■■■■■ 4.8
TRIOBP-209ENST00000428075 MLECQ14165 292 aa45■■■■■ 4.79
TRIOBP-209ENST00000428075 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
TRIOBP-209ENST00000428075 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.97■■■■■ 4.79
TRIOBP-209ENST00000428075 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.96■■■■■ 4.79
TRIOBP-209ENST00000428075 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.94■■■■■ 4.79
TRIOBP-209ENST00000428075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.91■■■■■ 4.78
TRIOBP-209ENST00000428075 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.9■■■■■ 4.78
TRIOBP-209ENST00000428075 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.89■■■■■ 4.78
TRIOBP-209ENST00000428075 ABCA6Q8N139 1617 aa44.89■■■■■ 4.78
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
TRIOBP-209ENST00000428075 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.86■■■■■ 4.77
TRIOBP-209ENST00000428075 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.86■■■■■ 4.77
TRIOBP-209ENST00000428075 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
TRIOBP-209ENST00000428075 REREQ9P2R6 1566 aa44.83■■■■■ 4.77
TRIOBP-209ENST00000428075 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.82■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.81■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.81■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.78■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.75■■■■■ 4.76
TRIOBP-209ENST00000428075 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.74■■■■■ 4.75
TRIOBP-209ENST00000428075 TIAM1Q13009 1591 aa44.72■■■■■ 4.75
TRIOBP-209ENST00000428075 AGLP35573 1532 aa44.7■■■■■ 4.75
TRIOBP-209ENST00000428075 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.66■■■■■ 4.74
TRIOBP-209ENST00000428075 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
TRIOBP-209ENST00000428075 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPA2P54652 639 aa44.62■■■■■ 4.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
TRIOBP-209ENST00000428075 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.58■■■■■ 4.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP7AQ04656 1500 aa44.56■■■■■ 4.72
TRIOBP-209ENST00000428075 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
TRIOBP-209ENST00000428075 NCOA2Q15596 1464 aa44.54■■■■■ 4.72
TRIOBP-209ENST00000428075 MBD5Q9P267 1494 aa44.54■■■■■ 4.72
TRIOBP-209ENST00000428075 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
TRIOBP-209ENST00000428075 PLXNC1O60486 1568 aa44.43■■■■■ 4.7
TRIOBP-209ENST00000428075 C3P01024 1663 aa44.43■■■■■ 4.7
TRIOBP-209ENST00000428075 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.42■■■■■ 4.7
TRIOBP-209ENST00000428075 A2MP01023 1474 aa44.41■■■■■ 4.7
TRIOBP-209ENST00000428075 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa44.41■■■■■ 4.7
TRIOBP-209ENST00000428075 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.34■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 CNTLNQ9NXG0 1405 aa44.34■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K1Q13233 1512 aa44.32■■■■■ 4.69
TRIOBP-209ENST00000428075 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.32■■■■■ 4.68
TRIOBP-209ENST00000428075 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.28■■■■■ 4.68
TRIOBP-209ENST00000428075 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.28■■■■■ 4.68
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.27■■■■■ 4.68
TRIOBP-209ENST00000428075 MROH2AA6NES4 1674 aa44.23■■■■■ 4.67
TRIOBP-209ENST00000428075 ZMYM3Q14202 1370 aa44.22■■■■■ 4.67
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TRIOBP-209ENST00000428075 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
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TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.17■■■■■ 4.66
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TRIOBP-209ENST00000428075 NPATQ14207 1427 aa44.13■■■■■ 4.65
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TRIOBP-209ENST00000428075 PPP6R1Q9UPN7 881 aa44.08■■■■■ 4.65
TRIOBP-209ENST00000428075 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.07■■■■■ 4.64
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TRIOBP-209ENST00000428075 MIA2Q96PC5 1412 aa44.03■■■■■ 4.64
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF3BO15066 747 aa44.01■■■■■ 4.64
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPY4P0CV99 314 aa44.01■■■■■ 4.64
TRIOBP-209ENST00000428075 TSPY10P0CW01 314 aa44.01■■■■■ 4.64
TRIOBP-209ENST00000428075 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.95■■■■■ 4.63
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TRIOBP-209ENST00000428075 NCOA1Q15788 1441 aa43.92■■■■■ 4.62
TRIOBP-209ENST00000428075 CERKQ8TCT0 537 aa43.89■■■■■ 4.62
TRIOBP-209ENST00000428075 APLP2Q06481 763 aa43.88■■■■■ 4.62
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TRIOBP-209ENST00000428075 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.85■■■■■ 4.61
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