RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.6■■■■□ 3.93
HTATSF1-202ENST00000425695 RICTORQ6R327 1708 aa39.56■■■■□ 3.92
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.55■■■■□ 3.92
HTATSF1-202ENST00000425695 PREX2Q70Z35 1606 aa39.54■■■■□ 3.92
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.54■■■■□ 3.92
HTATSF1-202ENST00000425695 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.52■■■■□ 3.92
HTATSF1-202ENST00000425695 TIAM1Q13009 1591 aa39.5■■■■□ 3.91
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
HTATSF1-202ENST00000425695 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.48■■■■□ 3.91
HTATSF1-202ENST00000425695 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.46■■■■□ 3.91
HTATSF1-202ENST00000425695 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
HTATSF1-202ENST00000425695 AFAP1Q8N556 730 aa39.41■■■■□ 3.9
HTATSF1-202ENST00000425695 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.38■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 APLP2Q06481 763 aa39.37■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.37■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.35■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.35■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.34■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC1P33527 1531 aa39.34■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOA2Q15596 1464 aa39.33■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.33■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K1Q13233 1512 aa39.33■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.32■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.32■■■■□ 3.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.31■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.31■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.3■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.3■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.29■■■■□ 3.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
HTATSF1-202ENST00000425695 KDM5CP41229 1560 aa39.23■■■■□ 3.87
HTATSF1-202ENST00000425695 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.23■■■■□ 3.87
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.17■■■■□ 3.86
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.16■■■■□ 3.86
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP10AO60312 1499 aa39.16■■■■□ 3.86
HTATSF1-202ENST00000425695 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.16■■■■□ 3.86
HTATSF1-202ENST00000425695 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.13■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.11■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.08■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 MLECQ14165 292 aa39.08■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.08■■■■□ 3.85
HTATSF1-202ENST00000425695 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.05■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.05■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA6Q8N139 1617 aa39.04■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.04■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.03■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 MBD5Q9P267 1494 aa39.02■■■■□ 3.84
HTATSF1-202ENST00000425695 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.99■■■■□ 3.83
HTATSF1-202ENST00000425695 MADDQ8WXG6 1647 aa38.95■■■■□ 3.83
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP7AQ04656 1500 aa38.94■■■■□ 3.82
HTATSF1-202ENST00000425695 MIA2Q96PC5 1412 aa38.9■■■■□ 3.82
HTATSF1-202ENST00000425695 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.89■■■■□ 3.82
HTATSF1-202ENST00000425695 REREQ9P2R6 1566 aa38.88■■■■□ 3.81
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRMP28827 1452 aa38.88■■■■□ 3.81
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.88■■■■□ 3.81
HTATSF1-202ENST00000425695 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
HTATSF1-202ENST00000425695 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.85■■■■□ 3.81
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY4P0CV99 314 aa38.82■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY10P0CW01 314 aa38.82■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.81■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.8■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 AGLP35573 1532 aa38.79■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.78■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 A2MP01023 1474 aa38.78■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.76■■■■□ 3.8
HTATSF1-202ENST00000425695 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.75■■■■□ 3.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.71■■■■□ 3.79
HTATSF1-202ENST00000425695 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
HTATSF1-202ENST00000425695 PLXNC1O60486 1568 aa38.66■■■■□ 3.78
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
HTATSF1-202ENST00000425695 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
HTATSF1-202ENST00000425695 GGT6Q6P531 493 aa38.64■■■■□ 3.78
HTATSF1-202ENST00000425695 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCC5O15440 1437 aa38.61■■■■□ 3.77
HTATSF1-202ENST00000425695 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.59■■■■□ 3.77
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF3BO15066 747 aa38.57■■■■□ 3.76
HTATSF1-202ENST00000425695 DAPK1P53355 1430 aa38.55■■■■□ 3.76
HTATSF1-202ENST00000425695 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.52■■■■□ 3.76
HTATSF1-202ENST00000425695 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
HTATSF1-202ENST00000425695 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.49■■■■□ 3.75
HTATSF1-202ENST00000425695 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.48■■■■□ 3.75
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.47■■■■□ 3.75
HTATSF1-202ENST00000425695 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.47■■■■□ 3.75
HTATSF1-202ENST00000425695 C3P01024 1663 aa38.44■■■■□ 3.74
HTATSF1-202ENST00000425695 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.42■■■■□ 3.74
HTATSF1-202ENST00000425695 ZMYM3Q14202 1370 aa38.41■■■■□ 3.74
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF15Q9NS87 1388 aa38.41■■■■□ 3.74
HTATSF1-202ENST00000425695 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.37■■■■□ 3.73
HTATSF1-202ENST00000425695 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.36■■■■□ 3.73
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.35■■■■□ 3.73
HTATSF1-202ENST00000425695 MROH2AA6NES4 1674 aa38.34■■■■□ 3.73
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