RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424529.6

VGLL4-208, Transcript of vestigial like family member 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VGLL4-208	ENST00000424529	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		34.06	■■■■□ 3.04
VGLL4-208	ENST00000424529	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		34.05	■■■■□ 3.04
VGLL4-208	ENST00000424529	RAPGEF3	O95398	923 aa		34.02	■■■■□ 3.04
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		34.02	■■■■□ 3.04
VGLL4-208	ENST00000424529	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	34.01	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	34	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.99	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.99	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.96	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.95	■■■■□ 3.03
VGLL4-208	ENST00000424529	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.94	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.92	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.91	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ABCC1	P33527	1531 aa		33.89	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.89	■■■■□ 3.02
VGLL4-208	ENST00000424529	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.88	■■■■□ 3.01
VGLL4-208	ENST00000424529	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
VGLL4-208	ENST00000424529	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.82	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	KDM5C	P41229	1560 aa		33.81	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.81	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	APLP2	Q06481	763 aa		33.8	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.8	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.8	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.79	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.78	■■■■□ 3
VGLL4-208	ENST00000424529	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.76	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.74	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.74	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.74	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.71	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.7	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.7	■■■□□ 2.99
VGLL4-208	ENST00000424529	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.69	■■■□□ 2.98
VGLL4-208	ENST00000424529	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.69	■■■□□ 2.98
VGLL4-208	ENST00000424529	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.67	■■■□□ 2.98
VGLL4-208	ENST00000424529	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.66	■■■□□ 2.98
VGLL4-208	ENST00000424529	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.64	■■■□□ 2.98
VGLL4-208	ENST00000424529	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.63	■■■□□ 2.97
VGLL4-208	ENST00000424529	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.6	■■■□□ 2.97
VGLL4-208	ENST00000424529	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.59	■■■□□ 2.97
VGLL4-208	ENST00000424529	ATP10A	O60312	1499 aa		33.59	■■■□□ 2.97
VGLL4-208	ENST00000424529	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.57	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.54	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.54	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.53	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.52	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
VGLL4-208	ENST00000424529	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.51	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.5	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.5	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.48	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.47	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.46	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.45	■■■□□ 2.95
VGLL4-208	ENST00000424529	AGL	P35573	1532 aa		33.41	■■■□□ 2.94
VGLL4-208	ENST00000424529	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.4	■■■□□ 2.94
VGLL4-208	ENST00000424529	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
VGLL4-208	ENST00000424529	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.37	■■■□□ 2.93
VGLL4-208	ENST00000424529	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.36	■■■□□ 2.93
VGLL4-208	ENST00000424529	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
VGLL4-208	ENST00000424529	ABCC5	O15440	1437 aa		33.34	■■■□□ 2.93
VGLL4-208	ENST00000424529	A2M	P01023	1474 aa		33.31	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.3	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.29	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.29	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	DAPK1	P53355	1430 aa		33.28	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.27	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.92
VGLL4-208	ENST00000424529	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.26	■■■□□ 2.91
VGLL4-208	ENST00000424529	MLEC	Q14165	292 aa		33.22	■■■□□ 2.91
VGLL4-208	ENST00000424529	PTPRM	P28827	1452 aa		33.22	■■■□□ 2.91
VGLL4-208	ENST00000424529	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.19	■■■□□ 2.9
VGLL4-208	ENST00000424529	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
VGLL4-208	ENST00000424529	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.15	■■■□□ 2.9
VGLL4-208	ENST00000424529	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
VGLL4-208	ENST00000424529	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
VGLL4-208	ENST00000424529	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VGLL4-208	ENST00000424529	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.11	■■■□□ 2.89
VGLL4-208	ENST00000424529	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.09	■■■□□ 2.89
VGLL4-208	ENST00000424529	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.07	■■■□□ 2.89
VGLL4-208	ENST00000424529	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.06	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.04	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	KIF3B	O15066	747 aa		33.03	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.03	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.03	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
VGLL4-208	ENST00000424529	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.01	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.01	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	GGT6	Q6P531	493 aa		33	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
VGLL4-208	ENST00000424529	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.99	■■■□□ 2.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms