RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422593.5

NICN1-202, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 3

Gene NICN1, Length 742 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-202ENST00000422593 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.78■■□□□ 1.08
NICN1-202ENST00000422593 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.78■■□□□ 1.08
NICN1-202ENST00000422593 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.78■■□□□ 1.08
NICN1-202ENST00000422593 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 MLECQ14165 292 aa21.76■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.76■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.75■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.74■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.74■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 KIF14Q15058 1648 aa21.73■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.72■■□□□ 1.07
NICN1-202ENST00000422593 FBXO41Q8TF61 875 aa21.7■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 HSPA2P54652 639 aa21.68■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 ATP10AO60312 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.67■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.66■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 CLIP1P30622 1438 aa21.66■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.65■■□□□ 1.06
NICN1-202ENST00000422593 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.63■■□□□ 1.05
NICN1-202ENST00000422593 AFAP1Q8N556 730 aa21.63■■□□□ 1.05
NICN1-202ENST00000422593 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.61■■□□□ 1.05
NICN1-202ENST00000422593 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.59■■□□□ 1.05
NICN1-202ENST00000422593 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 KDM5CP41229 1560 aa21.57■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.55■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 PREX2Q70Z35 1606 aa21.55■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.55■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.54■■□□□ 1.04
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NICN1-202ENST00000422593 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.52■■□□□ 1.04
NICN1-202ENST00000422593 ABCA6Q8N139 1617 aa21.51■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.48■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 ABCC1P33527 1531 aa21.48■■□□□ 1.03
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NICN1-202ENST00000422593 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 REREQ9P2R6 1566 aa21.47■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.46■■□□□ 1.03
NICN1-202ENST00000422593 C3P01024 1663 aa21.45■■□□□ 1.02
NICN1-202ENST00000422593 CERKQ8TCT0 537 aa21.45■■□□□ 1.02
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NICN1-202ENST00000422593 STRCQ7RTU9 1775 aa21.43■■□□□ 1.02
NICN1-202ENST00000422593 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.42■■□□□ 1.02
NICN1-202ENST00000422593 AGLP35573 1532 aa21.4■■□□□ 1.02
NICN1-202ENST00000422593 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.4■■□□□ 1.02
NICN1-202ENST00000422593 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
NICN1-202ENST00000422593 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.39■■□□□ 1.01
NICN1-202ENST00000422593 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NICN1-202ENST00000422593 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NICN1-202ENST00000422593 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.35■■□□□ 1.01
NICN1-202ENST00000422593 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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NICN1-202ENST00000422593 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.26■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 ZMYM3Q14202 1370 aa21.25■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 PTPRTO14522 1441 aa21.24■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 GGT6Q6P531 493 aa21.23■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 A2MP01023 1474 aa21.23■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.22■□□□□ 0.99
NICN1-202ENST00000422593 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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NICN1-202ENST00000422593 NPATQ14207 1427 aa21.2■□□□□ 0.98
NICN1-202ENST00000422593 PLXNC1O60486 1568 aa21.19■□□□□ 0.98
NICN1-202ENST00000422593 NCOA1Q15788 1441 aa21.19■□□□□ 0.98
NICN1-202ENST00000422593 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.19■□□□□ 0.98
NICN1-202ENST00000422593 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.15■□□□□ 0.98
NICN1-202ENST00000422593 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.14■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 CEP162Q5TB80 1403 aa21.13■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.13■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 MBD5Q9P267 1494 aa21.13■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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NICN1-202ENST00000422593 PTPRKQ15262 1439 aa21.12■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.1■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NICN1-202ENST00000422593 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
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NICN1-202ENST00000422593 PKD2Q13563 968 aa21.07■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 NCOA2Q15596 1464 aa21.07■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.06■□□□□ 0.96
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NICN1-202ENST00000422593 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.04■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.04■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.04■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 PLA2R1Q13018 1463 aa21.03■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
NICN1-202ENST00000422593 TSPY4P0CV99 314 aa21■□□□□ 0.95
NICN1-202ENST00000422593 TSPY10P0CW01 314 aa21■□□□□ 0.95
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