RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 PREX2Q70Z35 1606 aa36.65■■■■□ 3.46
CTU1-201ENST00000421832 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.62■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 MAPKBP1O60336 1514 aa36.59■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.57■■■■□ 3.45
CTU1-201ENST00000421832 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.56■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 PTPRKQ15262 1439 aa36.54■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.51■■■■□ 3.44
CTU1-201ENST00000421832 PLCH2O75038 1416 aa36.49■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.49■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 ABCC5O15440 1437 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 DAPK1P53355 1430 aa36.41■■■■□ 3.42
CTU1-201ENST00000421832 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.38■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.35■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.35■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 MBD5Q9P267 1494 aa36.33■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.32■■■■□ 3.41
CTU1-201ENST00000421832 CD109Q6YHK3 1445 aa36.32■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 DIP2BQ9P265 1576 aa36.32■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 FANCAO15360 1455 aa36.29■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.29■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 GLI2P10070 1586 aa36.28■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.28■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.26■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 ABCC1P33527 1531 aa36.26■■■■□ 3.4
CTU1-201ENST00000421832 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.24■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 AKNAQ7Z591 1439 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.23■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.22■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.22■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.21■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 HFM1A2PYH4 1435 aa36.21■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.2■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 NAIPQ13075 1403 aa36.2■■■■□ 3.39
CTU1-201ENST00000421832 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.18■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.18■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.15■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.14■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ROCK1Q13464 1354 aa36.14■■■■□ 3.38
CTU1-201ENST00000421832 ADGRL1O94910 1474 aa36.13■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 ADGRL2O95490 1459 aa36.12■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPOAP1O95153 1857 aa36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.11■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 NCOA1Q15788 1441 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPY4P0CV99 314 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 TSPY10P0CW01 314 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.1■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 KDM6BO15054 1643 aa36.09■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.08■■■■□ 3.37
CTU1-201ENST00000421832 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 AFAP1Q8N556 730 aa36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 NEO1Q92859 1461 aa36.03■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.03■■■■□ 3.36
CTU1-201ENST00000421832 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CTU1-201ENST00000421832 KIF15Q9NS87 1388 aa35.93■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 PLXNC1O60486 1568 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.91■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.89■■■■□ 3.34
CTU1-201ENST00000421832 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.86■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.86■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 ATP7AQ04656 1500 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 KDM5CP41229 1560 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.85■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RAPGEF3O95398 923 aa35.84■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 RICTORQ6R327 1708 aa35.83■■■■□ 3.33
CTU1-201ENST00000421832 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.82■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 NEUROD1Q13562 356 aa35.79■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.77■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CTU1-201ENST00000421832 TRIM52Q96A61 297 aa35.76■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.76■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.75■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.74■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.71■■■■□ 3.31
CTU1-201ENST00000421832 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 ERBINQ96RT1 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 ABCA6Q8N139 1617 aa35.65■■■■□ 3.3
CTU1-201ENST00000421832 PZPP20742 1482 aa35.61■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.6■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.58■■■■□ 3.29
CTU1-201ENST00000421832 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms