RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421101.1

LRRN3-202, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRRN3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-202ENST00000421101 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 KIF14Q15058 1648 aa11.16□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 MIA2Q96PC5 1412 aa11.15□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.14□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 ASXL2Q76L83 1435 aa11.14□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.13□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.09□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.09□□□□□ -0.63
LRRN3-202ENST00000421101 PLCH2O75038 1416 aa11.08□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 PTPRKQ15262 1439 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 MAPKBP1O60336 1514 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.04□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.03□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.03□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 PREX2Q70Z35 1606 aa11.03□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 ABCC5O15440 1437 aa11.03□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.02□□□□□ -0.64
LRRN3-202ENST00000421101 CD109Q6YHK3 1445 aa11.02□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.02□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.02□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 DAPK1P53355 1430 aa11.01□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 TSPY4P0CV99 314 aa11.01□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 TSPY10P0CW01 314 aa11.01□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 MBD5Q9P267 1494 aa11□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 SETD5Q9C0A6 1442 aa11□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.99□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 FANCAO15360 1455 aa10.99□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 HRCP23327 699 aa10.99□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.99□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.98□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 HFM1A2PYH4 1435 aa10.98□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 AKNAQ7Z591 1439 aa10.98□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 ROCK1Q13464 1354 aa10.97□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 NAIPQ13075 1403 aa10.96□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.96□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 AFAP1Q8N556 730 aa10.96□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 GLI2P10070 1586 aa10.96□□□□□ -0.65
LRRN3-202ENST00000421101 NCOA1Q15788 1441 aa10.96□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.95□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.95□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 CCDC141Q6ZP82 1450 aa10.95□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 C9orf84Q5VXU9 1444 aa10.95□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.95□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.94□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.94□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 DIP2BQ9P265 1576 aa10.94□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 ADGRL1O94910 1474 aa10.94□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 ABCC1P33527 1531 aa10.93□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.92□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.92□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 ADGRL2O95490 1459 aa10.92□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 NEO1Q92859 1461 aa10.91□□□□□ -0.66
LRRN3-202ENST00000421101 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.9□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 RAPGEF3O95398 923 aa10.89□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 KIF15Q9NS87 1388 aa10.89□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 TRIM52Q96A61 297 aa10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.88□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.87□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.87□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 KIF13AQ9H1H9 1805 aa10.87□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 TSPOAP1O95153 1857 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 KDM6BO15054 1643 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.85□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.84□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
LRRN3-202ENST00000421101 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
LRRN3-202ENST00000421101 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
LRRN3-202ENST00000421101 MLH3Q9UHC1 1453 aa10.83□□□□□ -0.68
LRRN3-202ENST00000421101 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms