RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIP2BQ9P265 1576 aa25.75■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.75■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.75■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.74■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.74■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.72■■□□□ 1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.7■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.69■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANCAO15360 1455 aa25.67■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.67■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.67■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.67■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.65■■□□□ 1.7
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.63■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.62■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEO1Q92859 1461 aa25.61■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKNAQ7Z591 1439 aa25.59■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBD5Q9P267 1494 aa25.59■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGAEP38570 1179 aa25.58■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.58■■□□□ 1.69
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAPK1P53355 1430 aa25.57■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC1P33527 1531 aa25.57■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC5O15440 1437 aa25.56■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRL1O94910 1474 aa25.55■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.55■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.54■■□□□ 1.68
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.53■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.52■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.52■■□□□ 1.68
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.51■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRKQ15262 1439 aa25.51■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPY4P0CV99 314 aa25.5■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPY10P0CW01 314 aa25.5■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.5■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.46■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 ROCK1Q13464 1354 aa25.46■■□□□ 1.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.44■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.44■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.43■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.43■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 AFAP1Q8N556 730 aa25.42■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRL2O95490 1459 aa25.41■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.4■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 HFM1A2PYH4 1435 aa25.4■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.4■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.39■■□□□ 1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.39■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA1Q15788 1441 aa25.38■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSPOAP1O95153 1857 aa25.35■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.35■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.34■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAIPQ13075 1403 aa25.34■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM5CP41229 1560 aa25.33■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAPGEF3O95398 923 aa25.33■■□□□ 1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.31■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.3■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.3■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF15Q9NS87 1388 aa25.3■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 HRCP23327 699 aa25.3■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP7AQ04656 1500 aa25.28■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLXNC1O60486 1568 aa25.27■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.27■■□□□ 1.64
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.26■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.25■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 RICTORQ6R327 1708 aa25.25■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.25■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.24■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.24■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.22■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.22■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.21■■□□□ 1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERBINQ96RT1 1412 aa25.18■■□□□ 1.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.17■■□□□ 1.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 KDM6BO15054 1643 aa25.14■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.13■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 A2MP01023 1474 aa25.12■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.1■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA6Q8N139 1617 aa25.09■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP10AO60312 1499 aa25.09■■□□□ 1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM52Q96A61 297 aa25.05■■□□□ 1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.04■■□□□ 1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 REREQ9P2R6 1566 aa25.03■■□□□ 1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF3BO15066 747 aa25.02■■□□□ 1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP155O75694 1391 aa25■■□□□ 1.59
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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