RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418779.5

C1orf228-203, Transcript of Uncharacterized protein C1orf228, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf228, Length 757 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf228-203ENST00000418779 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.95■■■■■ 4.47
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C1orf228-203ENST00000418779 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.88■■■■■ 4.46
C1orf228-203ENST00000418779 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.88■■■■■ 4.45
C1orf228-203ENST00000418779 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.87■■■■■ 4.45
C1orf228-203ENST00000418779 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.79■■■■■ 4.44
C1orf228-203ENST00000418779 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.78■■■■■ 4.44
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C1orf228-203ENST00000418779 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.7■■■■■ 4.43
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C1orf228-203ENST00000418779 AFAP1Q8N556 730 aa42.69■■■■■ 4.42
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C1orf228-203ENST00000418779 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.68■■■■■ 4.42
C1orf228-203ENST00000418779 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.66■■■■■ 4.42
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C1orf228-203ENST00000418779 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.62■■■■■ 4.41
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C1orf228-203ENST00000418779 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
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C1orf228-203ENST00000418779 PTPRMP28827 1452 aa42.45■■■■■ 4.39
C1orf228-203ENST00000418779 NCOA2Q15596 1464 aa42.45■■■■■ 4.39
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C1orf228-203ENST00000418779 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.43■■■■■ 4.38
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C1orf228-203ENST00000418779 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.42■■■■■ 4.38
C1orf228-203ENST00000418779 MAP3K1Q13233 1512 aa42.41■■■■■ 4.38
C1orf228-203ENST00000418779 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.4■■■■■ 4.38
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C1orf228-203ENST00000418779 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.11■■■■■ 4.33
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C1orf228-203ENST00000418779 MIA2Q96PC5 1412 aa41.98■■■■■ 4.31
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C1orf228-203ENST00000418779 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.83■■■■■ 4.29
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C1orf228-203ENST00000418779 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.82■■■■■ 4.29
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C1orf228-203ENST00000418779 ZMYM3Q14202 1370 aa41.7■■■■■ 4.27
C1orf228-203ENST00000418779 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.69■■■■■ 4.26
C1orf228-203ENST00000418779 KIF3BO15066 747 aa41.68■■■■■ 4.26
C1orf228-203ENST00000418779 ABCC5O15440 1437 aa41.68■■■■■ 4.26
C1orf228-203ENST00000418779 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.64■■■■■ 4.26
C1orf228-203ENST00000418779 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
C1orf228-203ENST00000418779 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.61■■■■■ 4.25
C1orf228-203ENST00000418779 DAPK1P53355 1430 aa41.61■■■■■ 4.25
C1orf228-203ENST00000418779 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.6■■■■■ 4.25
C1orf228-203ENST00000418779 NPATQ14207 1427 aa41.56■■■■■ 4.24
C1orf228-203ENST00000418779 PTPRKQ15262 1439 aa41.52■■■■■ 4.24
C1orf228-203ENST00000418779 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
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