RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 DIP2BQ9P265 1576 aa22.02■■□□□ 1.12
SFTA3-201ENST00000418548 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.01■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 FAM69CQ0P6D2 419 aa22■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.99■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 PREX2Q70Z35 1606 aa21.98■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 CD109Q6YHK3 1445 aa21.97■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.96■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.96■■□□□ 1.11
SFTA3-201ENST00000418548 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SFTA3-201ENST00000418548 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.94■■□□□ 1.1
SFTA3-201ENST00000418548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.94■■□□□ 1.1
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.91■■□□□ 1.1
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SFTA3-201ENST00000418548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 FANCAO15360 1455 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.85■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.85■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 NEO1Q92859 1461 aa21.83■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SFTA3-201ENST00000418548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.82■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 AKNAQ7Z591 1439 aa21.82■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 TSPOAP1O95153 1857 aa21.81■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.81■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 MBD5Q9P267 1494 aa21.81■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.8■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 ABCC1P33527 1531 aa21.79■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.78■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.78■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 ABCC5O15440 1437 aa21.77■■□□□ 1.08
SFTA3-201ENST00000418548 ADGRL1O94910 1474 aa21.77■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.76■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.76■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 DAPK1P53355 1430 aa21.75■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.75■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 PTPRKQ15262 1439 aa21.74■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.72■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 ITGAEP38570 1179 aa21.72■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.72■■□□□ 1.07
SFTA3-201ENST00000418548 TSPY4P0CV99 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 TSPY10P0CW01 314 aa21.69■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.69■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 AFAP1Q8N556 730 aa21.68■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.68■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.66■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.65■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 ROCK1Q13464 1354 aa21.65■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.65■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.64■■□□□ 1.06
SFTA3-201ENST00000418548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.64■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 ADGRL2O95490 1459 aa21.64■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.63■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 KDM5CP41229 1560 aa21.62■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 RAPGEF3O95398 923 aa21.62■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 RICTORQ6R327 1708 aa21.62■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 NCOA1Q15788 1441 aa21.62■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.6■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.59■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.58■■□□□ 1.05
SFTA3-201ENST00000418548 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.57■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 HFM1A2PYH4 1435 aa21.57■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.56■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 NAIPQ13075 1403 aa21.55■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.55■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 ATP7AQ04656 1500 aa21.55■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.55■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.54■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 PLXNC1O60486 1568 aa21.54■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.54■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.53■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.52■■□□□ 1.04
SFTA3-201ENST00000418548 HRCP23327 699 aa21.51■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 KIF15Q9NS87 1388 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.5■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 KDM6BO15054 1643 aa21.48■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.48■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.47■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.46■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.46■■□□□ 1.03
SFTA3-201ENST00000418548 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.44■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 ABCA6Q8N139 1617 aa21.44■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.43■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 ERBINQ96RT1 1412 aa21.41■■□□□ 1.02
SFTA3-201ENST00000418548 ATP10AO60312 1499 aa21.4■■□□□ 1.02
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