RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.57■■■■□ 3.93
CCZ1B-202ENST00000411858 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.57■■■■□ 3.92
CCZ1B-202ENST00000411858 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.53■■■■□ 3.92
CCZ1B-202ENST00000411858 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.51■■■■□ 3.92
CCZ1B-202ENST00000411858 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.49■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.48■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.47■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.46■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 MADDQ8WXG6 1647 aa39.45■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.45■■■■□ 3.91
CCZ1B-202ENST00000411858 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.44■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.44■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.43■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.43■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 PTPRMP28827 1452 aa39.41■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 PREX2Q70Z35 1606 aa39.4■■■■□ 3.9
CCZ1B-202ENST00000411858 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
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CCZ1B-202ENST00000411858 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
CCZ1B-202ENST00000411858 KDM5CP41229 1560 aa39.32■■■■□ 3.88
CCZ1B-202ENST00000411858 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.29■■■■□ 3.88
CCZ1B-202ENST00000411858 AFAP1Q8N556 730 aa39.28■■■■□ 3.88
CCZ1B-202ENST00000411858 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.27■■■■□ 3.88
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC1P33527 1531 aa39.25■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.25■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 TIAM1Q13009 1591 aa39.25■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.23■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.22■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 ATP10AO60312 1499 aa39.21■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.2■■■■□ 3.87
CCZ1B-202ENST00000411858 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.17■■■■□ 3.86
CCZ1B-202ENST00000411858 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.17■■■■□ 3.86
CCZ1B-202ENST00000411858 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
CCZ1B-202ENST00000411858 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.15■■■■□ 3.86
CCZ1B-202ENST00000411858 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.13■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.13■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 MAP3K1Q13233 1512 aa39.13■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCA6Q8N139 1617 aa39.12■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 NCOA2Q15596 1464 aa39.11■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.1■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 REREQ9P2R6 1566 aa39.08■■■■□ 3.85
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.05■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 MLECQ14165 292 aa39.04■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.04■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.04■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.03■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.01■■■■□ 3.84
CCZ1B-202ENST00000411858 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.99■■■■□ 3.83
CCZ1B-202ENST00000411858 APLP2Q06481 763 aa38.98■■■■□ 3.83
CCZ1B-202ENST00000411858 AGLP35573 1532 aa38.92■■■■□ 3.82
CCZ1B-202ENST00000411858 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
CCZ1B-202ENST00000411858 MBD5Q9P267 1494 aa38.9■■■■□ 3.82
CCZ1B-202ENST00000411858 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.86■■■■□ 3.81
CCZ1B-202ENST00000411858 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
CCZ1B-202ENST00000411858 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.8■■■■□ 3.8
CCZ1B-202ENST00000411858 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
CCZ1B-202ENST00000411858 ATP7AQ04656 1500 aa38.79■■■■□ 3.8
CCZ1B-202ENST00000411858 PREX1Q8TCU6 1659 aa38.78■■■■□ 3.8
CCZ1B-202ENST00000411858 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.75■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.74■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 C3P01024 1663 aa38.74■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 PLXNC1O60486 1568 aa38.72■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 MIA2Q96PC5 1412 aa38.72■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 HSPA2P54652 639 aa38.7■■■■□ 3.79
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.68■■■■□ 3.78
CCZ1B-202ENST00000411858 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.67■■■■□ 3.78
CCZ1B-202ENST00000411858 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CCZ1B-202ENST00000411858 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.63■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.62■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 A2MP01023 1474 aa38.61■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 MROH2AA6NES4 1674 aa38.6■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 TSPY4P0CV99 314 aa38.6■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 TSPY10P0CW01 314 aa38.6■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.59■■■■□ 3.77
CCZ1B-202ENST00000411858 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.54■■■■□ 3.76
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CCZ1B-202ENST00000411858 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.52■■■■□ 3.76
CCZ1B-202ENST00000411858 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
CCZ1B-202ENST00000411858 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
CCZ1B-202ENST00000411858 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.49■■■■□ 3.75
CCZ1B-202ENST00000411858 STRCQ7RTU9 1775 aa38.47■■■■□ 3.75
CCZ1B-202ENST00000411858 GGT6Q6P531 493 aa38.45■■■■□ 3.75
CCZ1B-202ENST00000411858 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
CCZ1B-202ENST00000411858 ABCC5O15440 1437 aa38.42■■■■□ 3.74
CCZ1B-202ENST00000411858 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
CCZ1B-202ENST00000411858 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.42■■■■□ 3.74
CCZ1B-202ENST00000411858 NPATQ14207 1427 aa38.39■■■■□ 3.74
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF3BO15066 747 aa38.38■■■■□ 3.73
CCZ1B-202ENST00000411858 ZMYM3Q14202 1370 aa38.38■■■■□ 3.73
CCZ1B-202ENST00000411858 DAPK1P53355 1430 aa38.33■■■■□ 3.73
CCZ1B-202ENST00000411858 PPP6R1Q9UPN7 881 aa38.33■■■■□ 3.73
CCZ1B-202ENST00000411858 FBXO41Q8TF61 875 aa38.31■■■■□ 3.72
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
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