RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.88■■■■■ 4.78
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.83■■■■■ 4.77
ANKRD54-203ENST00000407117 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.81■■■■■ 4.76
ANKRD54-203ENST00000407117 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
ANKRD54-203ENST00000407117 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.8■■■■■ 4.76
ANKRD54-203ENST00000407117 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.76■■■■■ 4.76
ANKRD54-203ENST00000407117 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.75■■■■■ 4.76
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.71■■■■■ 4.75
ANKRD54-203ENST00000407117 CEP162Q5TB80 1403 aa44.69■■■■■ 4.75
ANKRD54-203ENST00000407117 PREX2Q70Z35 1606 aa44.69■■■■■ 4.74
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRMP28827 1452 aa44.68■■■■■ 4.74
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa44.68■■■■■ 4.74
ANKRD54-203ENST00000407117 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.64■■■■■ 4.74
ANKRD54-203ENST00000407117 MADDQ8WXG6 1647 aa44.61■■■■■ 4.73
ANKRD54-203ENST00000407117 KDM5CP41229 1560 aa44.6■■■■■ 4.73
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP10AO60312 1499 aa44.59■■■■■ 4.73
ANKRD54-203ENST00000407117 AFAP1Q8N556 730 aa44.57■■■■■ 4.73
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCC1P33527 1531 aa44.55■■■■■ 4.72
ANKRD54-203ENST00000407117 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.55■■■■■ 4.72
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa44.55■■■■■ 4.72
ANKRD54-203ENST00000407117 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.52■■■■■ 4.72
ANKRD54-203ENST00000407117 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.51■■■■■ 4.72
ANKRD54-203ENST00000407117 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
ANKRD54-203ENST00000407117 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.47■■■■■ 4.71
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.47■■■■■ 4.71
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.45■■■■■ 4.71
ANKRD54-203ENST00000407117 ITSN2Q9NZM3 1697 aa44.44■■■■■ 4.7
ANKRD54-203ENST00000407117 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ANKRD54-203ENST00000407117 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.42■■■■■ 4.7
ANKRD54-203ENST00000407117 CCNB3Q8WWL7 1395 aa44.4■■■■■ 4.7
ANKRD54-203ENST00000407117 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa44.39■■■■■ 4.7
ANKRD54-203ENST00000407117 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.38■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 MLECQ14165 292 aa44.37■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.36■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 REREQ9P2R6 1566 aa44.36■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.36■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.32■■■■■ 4.69
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCA6Q8N139 1617 aa44.3■■■■■ 4.68
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.3■■■■■ 4.68
ANKRD54-203ENST00000407117 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.29■■■■■ 4.68
ANKRD54-203ENST00000407117 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa44.28■■■■■ 4.68
ANKRD54-203ENST00000407117 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.23■■■■■ 4.67
ANKRD54-203ENST00000407117 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.23■■■■■ 4.67
ANKRD54-203ENST00000407117 TIAM1Q13009 1591 aa44.22■■■■■ 4.67
ANKRD54-203ENST00000407117 AGLP35573 1532 aa44.21■■■■■ 4.67
ANKRD54-203ENST00000407117 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.67
ANKRD54-203ENST00000407117 LMTK3Q96Q04 1460 aa44.19■■■■■ 4.66
ANKRD54-203ENST00000407117 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
ANKRD54-203ENST00000407117 PLPPR3Q6T4P5 718 aa44.13■■■■■ 4.66
ANKRD54-203ENST00000407117 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
ANKRD54-203ENST00000407117 NCOA2Q15596 1464 aa44.08■■■■■ 4.65
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP7AQ04656 1500 aa44.08■■■■■ 4.65
ANKRD54-203ENST00000407117 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
ANKRD54-203ENST00000407117 MBD5Q9P267 1494 aa44.01■■■■■ 4.64
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.99■■■■■ 4.63
ANKRD54-203ENST00000407117 MAP3K1Q13233 1512 aa43.99■■■■■ 4.63
ANKRD54-203ENST00000407117 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
ANKRD54-203ENST00000407117 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
ANKRD54-203ENST00000407117 CNTLNQ9NXG0 1405 aa43.93■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 A2MP01023 1474 aa43.93■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 PLXNC1O60486 1568 aa43.92■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.9■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA2P54652 639 aa43.9■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.89■■■■■ 4.62
ANKRD54-203ENST00000407117 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.88■■■■■ 4.61
ANKRD54-203ENST00000407117 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.87■■■■■ 4.61
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.85■■■■■ 4.61
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.83■■■■■ 4.61
ANKRD54-203ENST00000407117 C3P01024 1663 aa43.82■■■■■ 4.61
ANKRD54-203ENST00000407117 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
ANKRD54-203ENST00000407117 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
ANKRD54-203ENST00000407117 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.79■■■■■ 4.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.74■■■■■ 4.59
ANKRD54-203ENST00000407117 MROH2AA6NES4 1674 aa43.74■■■■■ 4.59
ANKRD54-203ENST00000407117 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ANKRD54-203ENST00000407117 PPP6R1Q9UPN7 881 aa43.71■■■■■ 4.59
ANKRD54-203ENST00000407117 APLP2Q06481 763 aa43.69■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 MIA2Q96PC5 1412 aa43.68■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 ZMYM3Q14202 1370 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 MYOM3Q5VTT5 1437 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 GGT6Q6P531 493 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 NPATQ14207 1427 aa43.66■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 TSPY4P0CV99 314 aa43.65■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 TSPY10P0CW01 314 aa43.65■■■■■ 4.58
ANKRD54-203ENST00000407117 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF3BO15066 747 aa43.52■■■■■ 4.56
ANKRD54-203ENST00000407117 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.52■■■■■ 4.56
ANKRD54-203ENST00000407117 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.51■■■■■ 4.56
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.48■■■■■ 4.55
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRKQ15262 1439 aa43.47■■■■■ 4.55
ANKRD54-203ENST00000407117 STRCQ7RTU9 1775 aa43.44■■■■■ 4.55
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO41Q8TF61 875 aa43.44■■■■■ 4.54
ANKRD54-203ENST00000407117 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.39■■■■■ 4.54
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.34■■■■■ 4.53
ANKRD54-203ENST00000407117 NCOA1Q15788 1441 aa43.34■■■■■ 4.53
ANKRD54-203ENST00000407117 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms