RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.33■■■□□ 2.45
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ODC1-202ENST00000405333 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.24■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.22■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.22■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 DAPK1P53355 1430 aa30.22■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 ABCC5O15440 1437 aa30.21■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 PLCH2O75038 1416 aa30.21■■■□□ 2.43
ODC1-202ENST00000405333 MAPKBP1O60336 1514 aa30.19■■■□□ 2.42
ODC1-202ENST00000405333 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.14■■■□□ 2.42
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ODC1-202ENST00000405333 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ODC1-202ENST00000405333 MBD5Q9P267 1494 aa30.11■■■□□ 2.41
ODC1-202ENST00000405333 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.11■■■□□ 2.41
ODC1-202ENST00000405333 HFM1A2PYH4 1435 aa30.09■■■□□ 2.41
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ODC1-202ENST00000405333 NAIPQ13075 1403 aa30.08■■■□□ 2.41
ODC1-202ENST00000405333 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.07■■■□□ 2.4
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.06■■■□□ 2.4
ODC1-202ENST00000405333 HRCP23327 699 aa30.06■■■□□ 2.4
ODC1-202ENST00000405333 AKNAQ7Z591 1439 aa30.05■■■□□ 2.4
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.05■■■□□ 2.4
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ODC1-202ENST00000405333 CD109Q6YHK3 1445 aa30.03■■■□□ 2.4
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.99■■■□□ 2.39
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ODC1-202ENST00000405333 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.99■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 KDM6BO15054 1643 aa29.99■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 ROCK1Q13464 1354 aa29.99■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.98■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.98■■■□□ 2.39
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ODC1-202ENST00000405333 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.96■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 NCOA1Q15788 1441 aa29.96■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.95■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.95■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 ADGRL2O95490 1459 aa29.94■■■□□ 2.38
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ODC1-202ENST00000405333 TSPY10P0CW01 314 aa29.93■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.93■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 GLI2P10070 1586 aa29.93■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 ADGRL1O94910 1474 aa29.9■■■□□ 2.38
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ODC1-202ENST00000405333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.9■■■□□ 2.38
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.89■■■□□ 2.37
ODC1-202ENST00000405333 AFAP1Q8N556 730 aa29.88■■■□□ 2.37
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ODC1-202ENST00000405333 TSPOAP1O95153 1857 aa29.84■■■□□ 2.37
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ODC1-202ENST00000405333 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
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ODC1-202ENST00000405333 PLXNC1O60486 1568 aa29.74■■■□□ 2.35
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ODC1-202ENST00000405333 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
ODC1-202ENST00000405333 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.7■■■□□ 2.35
ODC1-202ENST00000405333 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.69■■■□□ 2.34
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ODC1-202ENST00000405333 RAPGEF3O95398 923 aa29.67■■■□□ 2.34
ODC1-202ENST00000405333 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.67■■■□□ 2.34
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ODC1-202ENST00000405333 KDM5CP41229 1560 aa29.65■■■□□ 2.34
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ODC1-202ENST00000405333 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.64■■■□□ 2.34
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ODC1-202ENST00000405333 RICTORQ6R327 1708 aa29.62■■■□□ 2.33
ODC1-202ENST00000405333 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.62■■■□□ 2.33
ODC1-202ENST00000405333 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-202ENST00000405333 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.59■■■□□ 2.33
ODC1-202ENST00000405333 PZPP20742 1482 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.57■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.56■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 FOXD1Q16676 465 aa29.55■■■□□ 2.32
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ODC1-202ENST00000405333 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.54■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.53■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 NUP155O75694 1391 aa29.53■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
ODC1-202ENST00000405333 ABCA6Q8N139 1617 aa29.5■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 UNC13BO14795 1591 aa29.48■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.313e-6■■□□□ 14.1
ODC1-202ENST00000405333 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
ODC1-202ENST00000405333 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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