RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.51■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.5■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 NEO1Q92859 1461 aa27.5■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.48■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 KDM6BO15054 1643 aa27.48■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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SEH1L-202ENST00000399892 AKNAQ7Z591 1439 aa27.45■■□□□ 1.99
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRL1O94910 1474 aa27.41■■□□□ 1.98
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SEH1L-202ENST00000399892 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.35■■□□□ 1.97
SEH1L-202ENST00000399892 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SEH1L-202ENST00000399892 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.31■■□□□ 1.96
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SEH1L-202ENST00000399892 MIA2Q96PC5 1412 aa27.3■■□□□ 1.96
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SEH1L-202ENST00000399892 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.27■■□□□ 1.96
SEH1L-202ENST00000399892 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.27■■□□□ 1.96
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SEH1L-202ENST00000399892 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.25■■□□□ 1.95
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SEH1L-202ENST00000399892 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.25■■□□□ 1.95
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.24■■□□□ 1.95
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SEH1L-202ENST00000399892 AFAP1Q8N556 730 aa27.21■■□□□ 1.95
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SEH1L-202ENST00000399892 KDM5CP41229 1560 aa27.14■■□□□ 1.94
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SEH1L-202ENST00000399892 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.12■■□□□ 1.93
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SEH1L-202ENST00000399892 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.11■■□□□ 1.93
SEH1L-202ENST00000399892 TSPY4P0CV99 314 aa27.09■■□□□ 1.93
SEH1L-202ENST00000399892 TSPY10P0CW01 314 aa27.09■■□□□ 1.93
SEH1L-202ENST00000399892 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.09■■□□□ 1.93
SEH1L-202ENST00000399892 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.05■■□□□ 1.92
SEH1L-202ENST00000399892 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.04■■□□□ 1.92
SEH1L-202ENST00000399892 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
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SEH1L-202ENST00000399892 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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SEH1L-202ENST00000399892 ABCC5O15440 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.99■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 ABCA6Q8N139 1617 aa26.98■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.98■■□□□ 1.91
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SEH1L-202ENST00000399892 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.97■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 ATP10AO60312 1499 aa26.96■■□□□ 1.91
SEH1L-202ENST00000399892 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.95■■□□□ 1.9
SEH1L-202ENST00000399892 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.95■■□□□ 1.9
SEH1L-202ENST00000399892 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SEH1L-202ENST00000399892 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.94■■□□□ 1.9
SEH1L-202ENST00000399892 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.91■■□□□ 1.9
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.87■■□□□ 1.89
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SEH1L-202ENST00000399892 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.78■■□□□ 1.88
SEH1L-202ENST00000399892 AGLP35573 1532 aa26.77■■□□□ 1.88
SEH1L-202ENST00000399892 ROCK1Q13464 1354 aa26.76■■□□□ 1.87
SEH1L-202ENST00000399892 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.75■■□□□ 1.87
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SEH1L-202ENST00000399892 ERBINQ96RT1 1412 aa26.7■■□□□ 1.87
SEH1L-202ENST00000399892 GGT6Q6P531 493 aa26.7■■□□□ 1.87
SEH1L-202ENST00000399892 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SEH1L-202ENST00000399892 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.67■■□□□ 1.86
SEH1L-202ENST00000399892 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.65■■□□□ 1.86
SEH1L-202ENST00000399892 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.64■■□□□ 1.86
SEH1L-202ENST00000399892 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.62■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 MADDQ8WXG6 1647 aa26.62■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.6■■□□□ 1.85
SEH1L-202ENST00000399892 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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