RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.05■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.02■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.02■■■□□ 2.08
UPP1-203ENST00000395564 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.01■■■□□ 2.07
UPP1-203ENST00000395564 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.99■■■□□ 2.07
UPP1-203ENST00000395564 AKNAQ7Z591 1439 aa27.98■■■□□ 2.07
UPP1-203ENST00000395564 KDM6BO15054 1643 aa27.96■■■□□ 2.07
UPP1-203ENST00000395564 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
UPP1-203ENST00000395564 ADGRL1O94910 1474 aa27.9■■■□□ 2.06
UPP1-203ENST00000395564 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.9■■■□□ 2.06
UPP1-203ENST00000395564 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
UPP1-203ENST00000395564 MIA2Q96PC5 1412 aa27.87■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.86■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.86■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.86■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 ABCC1P33527 1531 aa27.85■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.84■■■□□ 2.05
UPP1-203ENST00000395564 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.79■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 RICTORQ6R327 1708 aa27.79■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 RAPGEF3O95398 923 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-203ENST00000395564 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.75■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 MBD5Q9P267 1494 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 KDM5CP41229 1560 aa27.71■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
UPP1-203ENST00000395564 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.69■■■□□ 2.02
UPP1-203ENST00000395564 AFAP1Q8N556 730 aa27.69■■■□□ 2.02
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.68■■■□□ 2.02
UPP1-203ENST00000395564 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.65■■■□□ 2.02
UPP1-203ENST00000395564 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.65■■■□□ 2.02
UPP1-203ENST00000395564 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.62■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.59■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.58■■■□□ 2.01
UPP1-203ENST00000395564 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.57■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 TSPY4P0CV99 314 aa27.56■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 TSPY10P0CW01 314 aa27.56■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.55■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.54■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 ATP7AQ04656 1500 aa27.54■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.53■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 ABCC5O15440 1437 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 DAPK1P53355 1430 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-203ENST00000395564 ATP10AO60312 1499 aa27.5■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.5■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.49■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 ABCA6Q8N139 1617 aa27.48■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.48■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 REREQ9P2R6 1566 aa27.46■■□□□ 1.99
UPP1-203ENST00000395564 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-203ENST00000395564 PLXNC1O60486 1568 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-203ENST00000395564 ADGRL2O95490 1459 aa27.37■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 A2MP01023 1474 aa27.37■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.36■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 AGLP35573 1532 aa27.36■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 PTPRKQ15262 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 NCOA1Q15788 1441 aa27.34■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.34■■□□□ 1.97
UPP1-203ENST00000395564 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 ROCK1Q13464 1354 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 KIF15Q9NS87 1388 aa27.31■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.3■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 ITGAEP38570 1179 aa27.3■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-203ENST00000395564 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.25■■□□□ 1.95
UPP1-203ENST00000395564 ERBINQ96RT1 1412 aa27.24■■□□□ 1.95
UPP1-203ENST00000395564 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
UPP1-203ENST00000395564 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.19■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 KIF3BO15066 747 aa27.18■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.16■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 MLECQ14165 292 aa27.16■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.16■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.14■■□□□ 1.94
UPP1-203ENST00000395564 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
UPP1-203ENST00000395564 HFM1A2PYH4 1435 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-203ENST00000395564 GGT6Q6P531 493 aa27.11■■□□□ 1.93
UPP1-203ENST00000395564 NAIPQ13075 1403 aa27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms