RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.18■■■□□ 2.74
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CLDN3-201ENST00000395145 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRL1O94910 1474 aa32.14■■■□□ 2.74
CLDN3-201ENST00000395145 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.14■■■□□ 2.74
CLDN3-201ENST00000395145 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 RICTORQ6R327 1708 aa32.12■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.11■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 NCOA2Q15596 1464 aa32.1■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 RAPGEF3O95398 923 aa32.09■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.08■■■□□ 2.73
CLDN3-201ENST00000395145 APLP2Q06481 763 aa32.07■■■□□ 2.72
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CLDN3-201ENST00000395145 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.07■■■□□ 2.72
CLDN3-201ENST00000395145 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.05■■■□□ 2.72
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC1P33527 1531 aa32.04■■■□□ 2.72
CLDN3-201ENST00000395145 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.02■■■□□ 2.72
CLDN3-201ENST00000395145 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.01■■■□□ 2.71
CLDN3-201ENST00000395145 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CLDN3-201ENST00000395145 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.97■■■□□ 2.71
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.96■■■□□ 2.71
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.94■■■□□ 2.7
CLDN3-201ENST00000395145 KDM5CP41229 1560 aa31.94■■■□□ 2.7
CLDN3-201ENST00000395145 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.93■■■□□ 2.7
CLDN3-201ENST00000395145 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.92■■■□□ 2.7
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
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CLDN3-201ENST00000395145 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.9■■■□□ 2.7
CLDN3-201ENST00000395145 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.89■■■□□ 2.7
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CLDN3-201ENST00000395145 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.85■■■□□ 2.69
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
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CLDN3-201ENST00000395145 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.83■■■□□ 2.69
CLDN3-201ENST00000395145 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.82■■■□□ 2.68
CLDN3-201ENST00000395145 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.82■■■□□ 2.68
CLDN3-201ENST00000395145 MIA2Q96PC5 1412 aa31.82■■■□□ 2.68
CLDN3-201ENST00000395145 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.81■■■□□ 2.68
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CLDN3-201ENST00000395145 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.73■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 ATP10AO60312 1499 aa31.72■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.72■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.71■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 ABCA6Q8N139 1617 aa31.71■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CLDN3-201ENST00000395145 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.69■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.69■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.69■■■□□ 2.66
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CLDN3-201ENST00000395145 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.67■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 ATP7AQ04656 1500 aa31.67■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 REREQ9P2R6 1566 aa31.67■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.66■■■□□ 2.66
CLDN3-201ENST00000395145 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.66■■■□□ 2.66
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CLDN3-201ENST00000395145 MAST1Q9Y2H9 1570 aa31.55■■■□□ 2.64
CLDN3-201ENST00000395145 AGLP35573 1532 aa31.54■■■□□ 2.64
CLDN3-201ENST00000395145 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.53■■■□□ 2.64
CLDN3-201ENST00000395145 TSPY4P0CV99 314 aa31.51■■■□□ 2.63
CLDN3-201ENST00000395145 TSPY10P0CW01 314 aa31.51■■■□□ 2.63
CLDN3-201ENST00000395145 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
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CLDN3-201ENST00000395145 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
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CLDN3-201ENST00000395145 MADDQ8WXG6 1647 aa31.46■■■□□ 2.63
CLDN3-201ENST00000395145 DAPK1P53355 1430 aa31.45■■■□□ 2.63
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CLDN3-201ENST00000395145 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.22■■■□□ 2.59
CLDN3-201ENST00000395145 KIF3BO15066 747 aa31.21■■■□□ 2.59
CLDN3-201ENST00000395145 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.21■■■□□ 2.59
CLDN3-201ENST00000395145 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.2■■■□□ 2.59
CLDN3-201ENST00000395145 ERBINQ96RT1 1412 aa31.2■■■□□ 2.59
CLDN3-201ENST00000395145 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
CLDN3-201ENST00000395145 GGT6Q6P531 493 aa31.19■■■□□ 2.58
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