RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.13■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 PLCH2O75038 1416 aa27.12■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.11■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 PTPRKQ15262 1439 aa27.09■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.934e-6■■■■■ 30.2
UBXN6-202ENST00000394765 CD109Q6YHK3 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
UBXN6-202ENST00000394765 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.06■■□□□ 1.92
UBXN6-202ENST00000394765 DIP2BQ9P265 1576 aa27.05■■□□□ 1.92
UBXN6-202ENST00000394765 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
UBXN6-202ENST00000394765 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.01■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 FANCAO15360 1455 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC5O15440 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.98■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 GLI2P10070 1586 aa26.98■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 DAPK1P53355 1430 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 MBD5Q9P267 1494 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN6-202ENST00000394765 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.95■■□□□ 1.9
UBXN6-202ENST00000394765 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC1P33527 1531 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN6-202ENST00000394765 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.9■■□□□ 1.9
UBXN6-202ENST00000394765 AKNAQ7Z591 1439 aa26.89■■□□□ 1.9
UBXN6-202ENST00000394765 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.89■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.88■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.87■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 ADGRL1O94910 1474 aa26.87■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 AFAP1Q8N556 730 aa26.86■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 TSPOAP1O95153 1857 aa26.86■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.85■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.84■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.84■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.84■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
UBXN6-202ENST00000394765 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 HRCP23327 699 aa26.81■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 TSPY4P0CV99 314 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 TSPY10P0CW01 314 aa26.8■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 NAIPQ13075 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 NEO1Q92859 1461 aa26.78■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 HFM1A2PYH4 1435 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.77■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 RAPGEF3O95398 923 aa26.76■■□□□ 1.88
UBXN6-202ENST00000394765 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.76■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 NCOA1Q15788 1441 aa26.75■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.75■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.75■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 ROCK1Q13464 1354 aa26.73■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 KDM6BO15054 1643 aa26.71■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 ADGRL2O95490 1459 aa26.71■■□□□ 1.87
UBXN6-202ENST00000394765 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.7■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.7■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.69■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.67■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 KIF15Q9NS87 1388 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.65■■□□□ 1.86
UBXN6-202ENST00000394765 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 KDM5CP41229 1560 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 ATP7AQ04656 1500 aa26.6■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 RICTORQ6R327 1708 aa26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.58■■□□□ 1.85
UBXN6-202ENST00000394765 PLXNC1O60486 1568 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.56■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.53■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.52■■□□□ 1.84
UBXN6-202ENST00000394765 TRIM52Q96A61 297 aa26.51■■□□□ 1.83
UBXN6-202ENST00000394765 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.48■■□□□ 1.83
UBXN6-202ENST00000394765 ABCA6Q8N139 1617 aa26.47■■□□□ 1.83
UBXN6-202ENST00000394765 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.44■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.42■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 ERBINQ96RT1 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 A2MP01023 1474 aa26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
UBXN6-202ENST00000394765 KIF3BO15066 747 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 NUP155O75694 1391 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 FOXD1Q16676 465 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.37■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 PZPP20742 1482 aa26.35■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.34■■□□□ 1.81
UBXN6-202ENST00000394765 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms