RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PREX2Q70Z35 1606 aa35.26■■■■□ 3.23
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CNN3-202ENST00000394202 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.67■■■■□ 3.14
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CNN3-202ENST00000394202 KIF15Q9NS87 1388 aa34.64■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.64■■■■□ 3.14
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CNN3-202ENST00000394202 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.59■■■■□ 3.13
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CNN3-202ENST00000394202 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.56■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.56■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
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CNN3-202ENST00000394202 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
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CNN3-202ENST00000394202 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
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