RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 PREX2Q70Z35 1606 aa35.26■■■■□ 3.23
CNN3-202ENST00000394202 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.25■■■■□ 3.23
CNN3-202ENST00000394202 PLCH2O75038 1416 aa35.24■■■■□ 3.23
CNN3-202ENST00000394202 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.22■■■■□ 3.23
CNN3-202ENST00000394202 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.22■■■■□ 3.23
CNN3-202ENST00000394202 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.2■■■■□ 3.22
CNN3-202ENST00000394202 PTPRKQ15262 1439 aa35.18■■■■□ 3.22
CNN3-202ENST00000394202 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.13■■■■□ 3.22
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.12■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 CD109Q6YHK3 1445 aa35.11■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.1■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.216e-8■■■□□ 17.8
CNN3-202ENST00000394202 ABCC5O15440 1437 aa35.08■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.08■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 DIP2BQ9P265 1576 aa35.08■■■■□ 3.21
CNN3-202ENST00000394202 DAPK1P53355 1430 aa35.06■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.05■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 GLI2P10070 1586 aa35.05■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 FANCAO15360 1455 aa35.04■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 MBD5Q9P267 1494 aa35.03■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
CNN3-202ENST00000394202 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.01■■■■□ 3.19
CNN3-202ENST00000394202 SYCP2Q9BX26 1530 aa35■■■■□ 3.19
CNN3-202ENST00000394202 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.99■■■■□ 3.19
CNN3-202ENST00000394202 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.97■■■■□ 3.19
CNN3-202ENST00000394202 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.94■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 ABCC1P33527 1531 aa34.94■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.92■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.91■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 AKNAQ7Z591 1439 aa34.91■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.9■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.89■■■■□ 3.18
CNN3-202ENST00000394202 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.88■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 ADGRL1O94910 1474 aa34.87■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.87■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.87■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.86■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.85■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 TSPY4P0CV99 314 aa34.85■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 TSPY10P0CW01 314 aa34.85■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 HFM1A2PYH4 1435 aa34.84■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 AFAP1Q8N556 730 aa34.84■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 NAIPQ13075 1403 aa34.84■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.84■■■■□ 3.17
CNN3-202ENST00000394202 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.82■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 TSPOAP1O95153 1857 aa34.82■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 ROCK1Q13464 1354 aa34.82■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.81■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 NEO1Q92859 1461 aa34.8■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 NCOA1Q15788 1441 aa34.8■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.78■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 ADGRL2O95490 1459 aa34.77■■■■□ 3.16
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.73■■■■□ 3.15
CNN3-202ENST00000394202 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.71■■■■□ 3.15
CNN3-202ENST00000394202 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CNN3-202ENST00000394202 RAPGEF3O95398 923 aa34.69■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.69■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 KDM6BO15054 1643 aa34.68■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.67■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.67■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.66■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 KIF15Q9NS87 1388 aa34.64■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.64■■■■□ 3.14
CNN3-202ENST00000394202 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CNN3-202ENST00000394202 HRCP23327 699 aa34.62■■■■□ 3.13
CNN3-202ENST00000394202 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.6■■■■□ 3.13
CNN3-202ENST00000394202 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.59■■■■□ 3.13
CNN3-202ENST00000394202 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CNN3-202ENST00000394202 KDM5CP41229 1560 aa34.57■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.56■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.56■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 ATP7AQ04656 1500 aa34.55■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 PLXNC1O60486 1568 aa34.55■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 RICTORQ6R327 1708 aa34.53■■■■□ 3.12
CNN3-202ENST00000394202 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.51■■■■□ 3.11
CNN3-202ENST00000394202 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.51■■■■□ 3.11
CNN3-202ENST00000394202 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.49■■■■□ 3.11
CNN3-202ENST00000394202 TRIM52Q96A61 297 aa34.45■■■■□ 3.11
CNN3-202ENST00000394202 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.44■■■■□ 3.1
CNN3-202ENST00000394202 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.44■■■■□ 3.1
CNN3-202ENST00000394202 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.38■■■■□ 3.09
CNN3-202ENST00000394202 ERBINQ96RT1 1412 aa34.36■■■■□ 3.09
CNN3-202ENST00000394202 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.35■■■■□ 3.09
CNN3-202ENST00000394202 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CNN3-202ENST00000394202 ABCA6Q8N139 1617 aa34.35■■■■□ 3.09
CNN3-202ENST00000394202 A2MP01023 1474 aa34.3■■■■□ 3.08
CNN3-202ENST00000394202 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.3■■■■□ 3.08
CNN3-202ENST00000394202 MPHOSPH9Q99550 1183 aa34.29■■■■□ 3.08
CNN3-202ENST00000394202 NUP155O75694 1391 aa34.28■■■■□ 3.08
CNN3-202ENST00000394202 PZPP20742 1482 aa34.26■■■■□ 3.08
CNN3-202ENST00000394202 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.085e-7■■□□□ 11.9
CNN3-202ENST00000394202 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.26■■■■□ 3.07
CNN3-202ENST00000394202 KIF3BO15066 747 aa34.25■■■■□ 3.07
CNN3-202ENST00000394202 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CNN3-202ENST00000394202 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms