RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 PLCH2O75038 1416 aa43.5■■■■■ 4.55
GIPC1-202ENST00000393028 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.46■■■■■ 4.55
GIPC1-202ENST00000393028 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.43■■■■■ 4.54
GIPC1-202ENST00000393028 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
GIPC1-202ENST00000393028 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.39■■■■■ 4.54
GIPC1-202ENST00000393028 FANCAO15360 1455 aa43.37■■■■■ 4.53
GIPC1-202ENST00000393028 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.37■■■■■ 4.53
GIPC1-202ENST00000393028 MIA2Q96PC5 1412 aa43.36■■■■■ 4.53
GIPC1-202ENST00000393028 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.36■■■■■ 4.53
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
GIPC1-202ENST00000393028 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.32■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.29■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.28■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC1P33527 1531 aa43.24■■■■■ 4.51
GIPC1-202ENST00000393028 NEO1Q92859 1461 aa43.23■■■■■ 4.51
GIPC1-202ENST00000393028 AKNAQ7Z591 1439 aa43.21■■■■■ 4.51
GIPC1-202ENST00000393028 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.2■■■■■ 4.51
GIPC1-202ENST00000393028 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRL1O94910 1474 aa43.18■■■■■ 4.5
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.14■■■■■ 4.5
GIPC1-202ENST00000393028 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.14■■■■■ 4.5
GIPC1-202ENST00000393028 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.08■■■■■ 4.49
GIPC1-202ENST00000393028 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.06■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.05■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 MBD5Q9P267 1494 aa43.05■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.03■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.03■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.01■■■■■ 4.48
GIPC1-202ENST00000393028 RICTORQ6R327 1708 aa43.01■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.97■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.97■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.96■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 DAPK1P53355 1430 aa42.96■■■■■ 4.47
GIPC1-202ENST00000393028 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC5O15440 1437 aa42.94■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 ITGAEP38570 1179 aa42.94■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 KDM6BO15054 1643 aa42.91■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.9■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 RAPGEF3O95398 923 aa42.88■■■■■ 4.46
GIPC1-202ENST00000393028 AFAP1Q8N556 730 aa42.87■■■■■ 4.45
GIPC1-202ENST00000393028 KDM5CP41229 1560 aa42.87■■■■■ 4.45
GIPC1-202ENST00000393028 PTPRKQ15262 1439 aa42.86■■■■■ 4.45
GIPC1-202ENST00000393028 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.82■■■■■ 4.45
GIPC1-202ENST00000393028 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.81■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.8■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.8■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.79■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.78■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.78■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.77■■■■■ 4.44
GIPC1-202ENST00000393028 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.75■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.75■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 ATP7AQ04656 1500 aa42.74■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 TSPY4P0CV99 314 aa42.72■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 TSPY10P0CW01 314 aa42.72■■■■■ 4.43
GIPC1-202ENST00000393028 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.67■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRL2O95490 1459 aa42.66■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 PLXNC1O60486 1568 aa42.65■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.65■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 ABCA6Q8N139 1617 aa42.65■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.63■■■■■ 4.42
GIPC1-202ENST00000393028 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.59■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.58■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.57■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 ROCK1Q13464 1354 aa42.57■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.57■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 NCOA1Q15788 1441 aa42.57■■■■■ 4.41
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.57■■■■■ 4.4
GIPC1-202ENST00000393028 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.56■■■■■ 4.4
GIPC1-202ENST00000393028 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.55■■■■■ 4.4
GIPC1-202ENST00000393028 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.55■■■■■ 4.4
GIPC1-202ENST00000393028 KIF15Q9NS87 1388 aa42.51■■■■■ 4.4
GIPC1-202ENST00000393028 HFM1A2PYH4 1435 aa42.45■■■■■ 4.39
GIPC1-202ENST00000393028 NAIPQ13075 1403 aa42.45■■■■■ 4.39
GIPC1-202ENST00000393028 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.43■■■■■ 4.38
GIPC1-202ENST00000393028 A2MP01023 1474 aa42.4■■■■■ 4.38
GIPC1-202ENST00000393028 ATP10AO60312 1499 aa42.38■■■■■ 4.38
GIPC1-202ENST00000393028 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.37■■■■■ 4.37
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.33■■■■■ 4.37
GIPC1-202ENST00000393028 REREQ9P2R6 1566 aa42.32■■■■■ 4.37
GIPC1-202ENST00000393028 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.31■■■■■ 4.36
GIPC1-202ENST00000393028 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
GIPC1-202ENST00000393028 ERBINQ96RT1 1412 aa42.3■■■■■ 4.36
GIPC1-202ENST00000393028 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GIPC1-202ENST00000393028 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.23■■■■■ 4.35
GIPC1-202ENST00000393028 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.22■■■■■ 4.35
GIPC1-202ENST00000393028 AGLP35573 1532 aa42.16■■■■■ 4.34
GIPC1-202ENST00000393028 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
GIPC1-202ENST00000393028 DEPDC5O75140 1603 aa42.14■■■■■ 4.34
GIPC1-202ENST00000393028 KIF3BO15066 747 aa42.13■■■■■ 4.34
GIPC1-202ENST00000393028 UNC13BO14795 1591 aa42.13■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms