RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.98■■■□□ 2.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.98■■■□□ 2.87
UBE2E3-201ENST00000392415 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.95■■■□□ 2.87
UBE2E3-201ENST00000392415 PREX2Q70Z35 1606 aa32.95■■■□□ 2.87
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.93■■■□□ 2.86
UBE2E3-201ENST00000392415 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.91■■■□□ 2.86
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.91■■■□□ 2.86
UBE2E3-201ENST00000392415 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.87■■■□□ 2.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.86■■■□□ 2.85
UBE2E3-201ENST00000392415 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.85■■■□□ 2.85
UBE2E3-201ENST00000392415 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.83■■■□□ 2.85
UBE2E3-201ENST00000392415 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.81■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 AFAP1Q8N556 730 aa32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC1P33527 1531 aa32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM5CP41229 1560 aa32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.79■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.78■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.77■■■□□ 2.84
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.75■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.74■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.73■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TIAM1Q13009 1591 aa32.72■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.72■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP10AO60312 1499 aa32.71■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.71■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.82
UBE2E3-201ENST00000392415 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.69■■■□□ 2.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.68■■■□□ 2.82
UBE2E3-201ENST00000392415 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.67■■■□□ 2.82
UBE2E3-201ENST00000392415 MADDQ8WXG6 1647 aa32.65■■■□□ 2.82
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRMP28827 1452 aa32.63■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.63■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.62■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.62■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.61■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K1Q13233 1512 aa32.61■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.817e-8■■■■□ 26.6
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UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.59■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA6Q8N139 1617 aa32.58■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.58■■■□□ 2.81
UBE2E3-201ENST00000392415 REREQ9P2R6 1566 aa32.57■■■□□ 2.8
UBE2E3-201ENST00000392415 MLECQ14165 292 aa32.54■■■□□ 2.8
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
UBE2E3-201ENST00000392415 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
UBE2E3-201ENST00000392415 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
UBE2E3-201ENST00000392415 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.47■■■□□ 2.79
UBE2E3-201ENST00000392415 MBD5Q9P267 1494 aa32.46■■■□□ 2.79
UBE2E3-201ENST00000392415 AGLP35573 1532 aa32.45■■■□□ 2.79
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UBE2E3-201ENST00000392415 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
UBE2E3-201ENST00000392415 APLP2Q06481 763 aa32.4■■■□□ 2.78
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.4■■■□□ 2.78
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.35■■■□□ 2.77
UBE2E3-201ENST00000392415 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.34■■■□□ 2.77
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.32■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 A2MP01023 1474 aa32.31■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 PLXNC1O60486 1568 aa32.3■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.3■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.3■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 MIA2Q96PC5 1412 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2E3-201ENST00000392415 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.26■■■□□ 2.75
UBE2E3-201ENST00000392415 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
UBE2E3-201ENST00000392415 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.19■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPY4P0CV99 314 aa32.19■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 TSPY10P0CW01 314 aa32.19■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 C3P01024 1663 aa32.17■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
UBE2E3-201ENST00000392415 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.13■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH2AA6NES4 1674 aa32.11■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.11■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 GGT6Q6P531 493 aa32.11■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.1■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.1■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.08■■■□□ 2.73
UBE2E3-201ENST00000392415 HSPA2P54652 639 aa32.06■■■□□ 2.72
UBE2E3-201ENST00000392415 ZMYM3Q14202 1370 aa32.06■■■□□ 2.72
UBE2E3-201ENST00000392415 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF3BO15066 747 aa32.03■■■□□ 2.72
UBE2E3-201ENST00000392415 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
UBE2E3-201ENST00000392415 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.01■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC5O15440 1437 aa32■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 NPATQ14207 1427 aa31.99■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.97■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.97■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
UBE2E3-201ENST00000392415 DAPK1P53355 1430 aa31.94■■■□□ 2.7
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.94■■■□□ 2.7
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPRKQ15262 1439 aa31.91■■■□□ 2.7
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