RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 PREX2Q70Z35 1606 aa23.27■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.27■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 ADGRL1O94910 1474 aa23.26■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 NCOA2Q15596 1464 aa23.26■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 RAPGEF3O95398 923 aa23.25■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.25■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.25■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.22■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PXDC1-201ENST00000380277 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.19■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.17■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC1P33527 1531 aa23.16■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 RICTORQ6R327 1708 aa23.15■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.15■■□□□ 1.3
PXDC1-201ENST00000380277 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.14■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.13■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.11■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.1■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.1■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.1■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.09■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 AFAP1Q8N556 730 aa23.09■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.09■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.08■■□□□ 1.29
PXDC1-201ENST00000380277 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.07■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 KDM5CP41229 1560 aa23.06■■□□□ 1.28
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PXDC1-201ENST00000380277 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.04■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.03■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.03■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.03■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 MBD5Q9P267 1494 aa23.02■■□□□ 1.28
PXDC1-201ENST00000380277 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.01■■□□□ 1.27
PXDC1-201ENST00000380277 MLH3Q9UHC1 1453 aa23■■□□□ 1.27
PXDC1-201ENST00000380277 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.98■■□□□ 1.27
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PXDC1-201ENST00000380277 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.97■■□□□ 1.27
PXDC1-201ENST00000380277 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.97■■□□□ 1.27
PXDC1-201ENST00000380277 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.94■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.94■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 HRCP23327 699 aa22.93■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 ATP10AO60312 1499 aa22.93■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.92■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.91■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.91■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.9■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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PXDC1-201ENST00000380277 ABCA6Q8N139 1617 aa22.89■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 ATP7AQ04656 1500 aa22.89■■□□□ 1.26
PXDC1-201ENST00000380277 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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PXDC1-201ENST00000380277 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.88■■□□□ 1.25
PXDC1-201ENST00000380277 TSPY4P0CV99 314 aa22.85■■□□□ 1.25
PXDC1-201ENST00000380277 TSPY10P0CW01 314 aa22.85■■□□□ 1.25
PXDC1-201ENST00000380277 REREQ9P2R6 1566 aa22.84■■□□□ 1.25
PXDC1-201ENST00000380277 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.84■■□□□ 1.25
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC5O15440 1437 aa22.82■■□□□ 1.24
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PXDC1-201ENST00000380277 DAPK1P53355 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.79■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 A2MP01023 1474 aa22.78■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.78■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 AGLP35573 1532 aa22.77■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.77■■□□□ 1.24
PXDC1-201ENST00000380277 PLXNC1O60486 1568 aa22.75■■□□□ 1.23
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PXDC1-201ENST00000380277 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.75■■□□□ 1.23
PXDC1-201ENST00000380277 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.74■■□□□ 1.23
PXDC1-201ENST00000380277 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.73■■□□□ 1.23
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PXDC1-201ENST00000380277 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.68■■□□□ 1.22
PXDC1-201ENST00000380277 KIF15Q9NS87 1388 aa22.66■■□□□ 1.22
PXDC1-201ENST00000380277 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.65■■□□□ 1.22
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PXDC1-201ENST00000380277 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.65■■□□□ 1.22
PXDC1-201ENST00000380277 PTPRMP28827 1452 aa22.64■■□□□ 1.22
PXDC1-201ENST00000380277 NCOA1Q15788 1441 aa22.64■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 ADGRL2O95490 1459 aa22.64■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.63■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 KIF3BO15066 747 aa22.62■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 GGT6Q6P531 493 aa22.62■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 ITGAEP38570 1179 aa22.61■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.6■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 ERBINQ96RT1 1412 aa22.58■■□□□ 1.21
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