RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLCH2O75038 1416 aa42.1■■■■■ 4.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.07■■■■■ 4.33
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIP2BQ9P265 1576 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAPPC10-202ENST00000380221 ITGAEP38570 1179 aa42.03■■■■■ 4.32
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLI2P10070 1586 aa42.01■■■■■ 4.32
TRAPPC10-202ENST00000380221 CD109Q6YHK3 1445 aa41.99■■■■■ 4.31
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.99■■■■■ 4.31
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.97■■■■■ 4.31
TRAPPC10-202ENST00000380221 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.97■■■■■ 4.31
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.95■■■■■ 4.31
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.93■■■■■ 4.3
TRAPPC10-202ENST00000380221 FANCAO15360 1455 aa41.89■■■■■ 4.3
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.88■■■■■ 4.29
TRAPPC10-202ENST00000380221 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
TRAPPC10-202ENST00000380221 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.295e-7■■■■□ 20.5
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRKQ15262 1439 aa41.83■■■■■ 4.29
TRAPPC10-202ENST00000380221 DAPK1P53355 1430 aa41.81■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.8■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC5O15440 1437 aa41.79■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.78■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 MBD5Q9P267 1494 aa41.78■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC1P33527 1531 aa41.77■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.76■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.76■■■■■ 4.28
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPOAP1O95153 1857 aa41.75■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.73■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.73■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKNAQ7Z591 1439 aa41.73■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.71■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRL1O94910 1474 aa41.69■■■■■ 4.27
TRAPPC10-202ENST00000380221 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.69■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.66■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEO1Q92859 1461 aa41.66■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.65■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.64■■■■■ 4.26
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.62■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPY4P0CV99 314 aa41.59■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPY10P0CW01 314 aa41.59■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.58■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.57■■■■■ 4.25
TRAPPC10-202ENST00000380221 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.56■■■■■ 4.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 AFAP1Q8N556 730 aa41.55■■■■■ 4.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.54■■■■■ 4.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 ROCK1Q13464 1354 aa41.52■■■■■ 4.24
TRAPPC10-202ENST00000380221 HFM1A2PYH4 1435 aa41.49■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRL2O95490 1459 aa41.48■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.47■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.47■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 NCOA1Q15788 1441 aa41.47■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 NAIPQ13075 1403 aa41.46■■■■■ 4.23
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.44■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.44■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.44■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.41■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.4■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAPGEF3O95398 923 aa41.4■■■■■ 4.22
TRAPPC10-202ENST00000380221 HRCP23327 699 aa41.37■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM5CP41229 1560 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RICTORQ6R327 1708 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.34■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF15Q9NS87 1388 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLXNC1O60486 1568 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP7AQ04656 1500 aa41.31■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.3■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM6BO15054 1643 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.26■■■■■ 4.2
TRAPPC10-202ENST00000380221 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
TRAPPC10-202ENST00000380221 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.24■■■■■ 4.19
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.23■■■■■ 4.19
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.2■■■■■ 4.19
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.16■■■■■ 4.18
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.14■■■■■ 4.18
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCA6Q8N139 1617 aa41.09■■■■■ 4.17
TRAPPC10-202ENST00000380221 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.06■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERBINQ96RT1 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRIM52Q96A61 297 aa41.03■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.02■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.02■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
TRAPPC10-202ENST00000380221 A2MP01023 1474 aa40.99■■■■■ 4.15
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATP10AO60312 1499 aa40.87■■■■■ 4.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF3BO15066 747 aa40.86■■■■■ 4.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC13BO14795 1591 aa40.86■■■■■ 4.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUP155O75694 1391 aa40.86■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms