RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 APLP2Q06481 763 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 NCOA2Q15596 1464 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC25A39-202ENST00000377095 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRL1O94910 1474 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC25A39-202ENST00000377095 RAPGEF3O95398 923 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.98■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 RICTORQ6R327 1708 aa29.98■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.96■■■□□ 2.39
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC1P33527 1531 aa29.94■■■□□ 2.38
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SLC25A39-202ENST00000377095 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.85■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 AFAP1Q8N556 730 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-202ENST00000377095 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.362e-7■■■□□ 14.8
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM5CP41229 1560 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 MIA2Q96PC5 1412 aa29.81■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.8■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 MBD5Q9P267 1494 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-202ENST00000377095 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.7■■■□□ 2.35
SLC25A39-202ENST00000377095 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.64■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
SLC25A39-202ENST00000377095 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCA6Q8N139 1617 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 ATP10AO60312 1499 aa29.61■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 ATP7AQ04656 1500 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-202ENST00000377095 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.55■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 REREQ9P2R6 1566 aa29.53■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 TSPY4P0CV99 314 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 TSPY10P0CW01 314 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC5O15440 1437 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-202ENST00000377095 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 DAPK1P53355 1430 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.46■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC25A39-202ENST00000377095 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.45■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.39e-7■■■□□ 14.9
SLC25A39-202ENST00000377095 A2MP01023 1474 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 PLXNC1O60486 1568 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 AGLP35573 1532 aa29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-202ENST00000377095 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPRKQ15262 1439 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC25A39-202ENST00000377095 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC25A39-202ENST00000377095 MLECQ14165 292 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-202ENST00000377095 MADDQ8WXG6 1647 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 ADGRL2O95490 1459 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 NCOA1Q15788 1441 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF15Q9NS87 1388 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.28■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-202ENST00000377095 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 ITGAEP38570 1179 aa29.24■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF3BO15066 747 aa29.22■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 ROCK1Q13464 1354 aa29.2■■■□□ 2.27
SLC25A39-202ENST00000377095 PTPRMP28827 1452 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A39-202ENST00000377095 GGT6Q6P531 493 aa29.19■■■□□ 2.26
SLC25A39-202ENST00000377095 ERBINQ96RT1 1412 aa29.18■■■□□ 2.26
SLC25A39-202ENST00000377095 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
SLC25A39-202ENST00000377095 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms