RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.55■■■□□ 2
USP11-202ENST00000377078 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.53■■■□□ 2
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USP11-202ENST00000377078 CEP162Q5TB80 1403 aa27.52■■■□□ 2
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USP11-202ENST00000377078 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.45■■□□□ 1.99
USP11-202ENST00000377078 PREX2Q70Z35 1606 aa27.45■■□□□ 1.98
USP11-202ENST00000377078 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.42■■□□□ 1.98
USP11-202ENST00000377078 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.41■■□□□ 1.98
USP11-202ENST00000377078 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.41■■□□□ 1.98
USP11-202ENST00000377078 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.41■■□□□ 1.98
USP11-202ENST00000377078 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.41■■□□□ 1.98
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USP11-202ENST00000377078 AFAP1Q8N556 730 aa27.36■■□□□ 1.97
USP11-202ENST00000377078 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.36■■□□□ 1.97
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USP11-202ENST00000377078 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.34■■□□□ 1.97
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USP11-202ENST00000377078 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.2■■□□□ 1.94
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USP11-202ENST00000377078 HSPA2P54652 639 aa26.89■■□□□ 1.9
USP11-202ENST00000377078 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.87■■□□□ 1.89
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USP11-202ENST00000377078 MIA2Q96PC5 1412 aa26.86■■□□□ 1.89
USP11-202ENST00000377078 GGT6Q6P531 493 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP11-202ENST00000377078 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.7■■□□□ 1.86
USP11-202ENST00000377078 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.69■■□□□ 1.86
USP11-202ENST00000377078 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.67■■□□□ 1.86
USP11-202ENST00000377078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.65■■□□□ 1.86
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USP11-202ENST00000377078 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.62■■□□□ 1.85
USP11-202ENST00000377078 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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