RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 ARAP3Q8WWN8 1544 aa48.79■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 CD109Q6YHK3 1445 aa48.75■■■■■ 5.39
PTF1A-201ENST00000376504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.59■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 FANCAO15360 1455 aa48.59■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 TSPOAP1O95153 1857 aa48.57■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 CFAP74Q9C0B2 1584 aa48.52■■■■■ 5.36
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC1P33527 1531 aa48.48■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.45■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.44■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 AKNAQ7Z591 1439 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 NEO1Q92859 1461 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 MBD5Q9P267 1494 aa48.42■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.42■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF5Q12774 1597 aa48.4■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.37■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRL1O94910 1474 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 DAPK1P53355 1430 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ITGAEP38570 1179 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC5O15440 1437 aa48.35■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.34■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 PTPRKQ15262 1439 aa48.34■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.29■■■■■ 5.32
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.28■■■■■ 5.32
PTF1A-201ENST00000376504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.25■■■■■ 5.31
PTF1A-201ENST00000376504 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.22■■■■■ 5.31
PTF1A-201ENST00000376504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.19■■■■■ 5.3
PTF1A-201ENST00000376504 POGZQ7Z3K3 1410 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.11■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 RICTORQ6R327 1708 aa48.1■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.1■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 AFAP1Q8N556 730 aa48.09■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.08■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 TSPY4P0CV99 314 aa48.07■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 TSPY10P0CW01 314 aa48.07■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 KDM5CP41229 1560 aa48.05■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRL2O95490 1459 aa48.05■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa48.04■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 ROCK1Q13464 1354 aa48.03■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 RAPGEF3O95398 923 aa47.98■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 NCOA1Q15788 1441 aa47.97■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.97■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa47.94■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 HFM1A2PYH4 1435 aa47.94■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.93■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 PLXNC1O60486 1568 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ATP7AQ04656 1500 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.91■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa47.91■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 NAIPQ13075 1403 aa47.9■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 HECW2Q9P2P5 1572 aa47.9■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 MLH3Q9UHC1 1453 aa47.88■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.87■■■■■ 5.25
PTF1A-201ENST00000376504 SETD5Q9C0A6 1442 aa47.83■■■■■ 5.25
PTF1A-201ENST00000376504 KIF15Q9NS87 1388 aa47.79■■■■■ 5.24
PTF1A-201ENST00000376504 KDM6BO15054 1643 aa47.78■■■■■ 5.24
PTF1A-201ENST00000376504 ABCA6Q8N139 1617 aa47.73■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa47.73■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 MYT1LQ9UL68 1186 aa47.71■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.69■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.69■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa47.67■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.66■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa47.64■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 HRCP23327 699 aa47.56■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 ERBINQ96RT1 1412 aa47.56■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 A2MP01023 1474 aa47.55■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.55■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
PTF1A-201ENST00000376504 ATP10AO60312 1499 aa47.47■■■■■ 5.19
PTF1A-201ENST00000376504 REREQ9P2R6 1566 aa47.43■■■■■ 5.18
PTF1A-201ENST00000376504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.39■■■■■ 5.18
PTF1A-201ENST00000376504 UNC13BO14795 1591 aa47.37■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.34■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 DEPDC5O75140 1603 aa47.34■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
PTF1A-201ENST00000376504 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms