RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 ARAP3Q8WWN8 1544 aa48.79■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGAP5Q13017 1502 aa48.76■■■■■ 5.4
PTF1A-201ENST00000376504 CD109Q6YHK3 1445 aa48.75■■■■■ 5.39
PTF1A-201ENST00000376504 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa48.67■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa48.59■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 FANCAO15360 1455 aa48.59■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 TSPOAP1O95153 1857 aa48.57■■■■■ 5.37
PTF1A-201ENST00000376504 CFAP74Q9C0B2 1584 aa48.52■■■■■ 5.36
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC1P33527 1531 aa48.48■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.45■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.44■■■■■ 5.35
PTF1A-201ENST00000376504 AKNAQ7Z591 1439 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 NEO1Q92859 1461 aa48.43■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 MBD5Q9P267 1494 aa48.42■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.42■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF5Q12774 1597 aa48.4■■■■■ 5.34
PTF1A-201ENST00000376504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.37■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRL1O94910 1474 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 DAPK1P53355 1430 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ITGAEP38570 1179 aa48.36■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 ABCC5O15440 1437 aa48.35■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 CROCC2H7BZ55 1655 aa48.34■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 PTPRKQ15262 1439 aa48.34■■■■■ 5.33
PTF1A-201ENST00000376504 SCAPERQ9BY12 1400 aa48.29■■■■■ 5.32
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC141Q6ZP82 1450 aa48.28■■■■■ 5.32
PTF1A-201ENST00000376504 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.25■■■■■ 5.31
PTF1A-201ENST00000376504 RSPH4AQ5TD94 716 aa48.22■■■■■ 5.31
PTF1A-201ENST00000376504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.19■■■■■ 5.3
PTF1A-201ENST00000376504 POGZQ7Z3K3 1410 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.12■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.11■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 RICTORQ6R327 1708 aa48.1■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.1■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 AFAP1Q8N556 730 aa48.09■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.08■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 TSPY4P0CV99 314 aa48.07■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 TSPY10P0CW01 314 aa48.07■■■■■ 5.29
PTF1A-201ENST00000376504 KDM5CP41229 1560 aa48.05■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRL2O95490 1459 aa48.05■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa48.04■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 ROCK1Q13464 1354 aa48.03■■■■■ 5.28
PTF1A-201ENST00000376504 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 RAPGEF3O95398 923 aa47.98■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 NCOA1Q15788 1441 aa47.97■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa47.97■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa47.94■■■■■ 5.27
PTF1A-201ENST00000376504 HFM1A2PYH4 1435 aa47.94■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.93■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 PLXNC1O60486 1568 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ATP7AQ04656 1500 aa47.92■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa47.91■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa47.91■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 NAIPQ13075 1403 aa47.9■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 HECW2Q9P2P5 1572 aa47.9■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 MLH3Q9UHC1 1453 aa47.88■■■■■ 5.26
PTF1A-201ENST00000376504 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.87■■■■■ 5.25
PTF1A-201ENST00000376504 SETD5Q9C0A6 1442 aa47.83■■■■■ 5.25
PTF1A-201ENST00000376504 KIF15Q9NS87 1388 aa47.79■■■■■ 5.24
PTF1A-201ENST00000376504 KDM6BO15054 1643 aa47.78■■■■■ 5.24
PTF1A-201ENST00000376504 ABCA6Q8N139 1617 aa47.73■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa47.73■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 MYT1LQ9UL68 1186 aa47.71■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 DUOX2Q9NRD8 1548 aa47.69■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 MAGI2Q86UL8 1455 aa47.69■■■■■ 5.23
PTF1A-201ENST00000376504 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa47.67■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.66■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa47.64■■■■■ 5.22
PTF1A-201ENST00000376504 HRCP23327 699 aa47.56■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 ERBINQ96RT1 1412 aa47.56■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 A2MP01023 1474 aa47.55■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.55■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
PTF1A-201ENST00000376504 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
PTF1A-201ENST00000376504 ATP10AO60312 1499 aa47.47■■■■■ 5.19
PTF1A-201ENST00000376504 REREQ9P2R6 1566 aa47.43■■■■■ 5.18
PTF1A-201ENST00000376504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa47.39■■■■■ 5.18
PTF1A-201ENST00000376504 UNC13BO14795 1591 aa47.37■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa47.34■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 DEPDC5O75140 1603 aa47.34■■■■■ 5.17
PTF1A-201ENST00000376504 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP47.3■■■■■ 5.16
PTF1A-201ENST00000376504 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
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