RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376365.7

GKAP1-202, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GKAP1, Length 1,511 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-202ENST00000376365 NEO1Q92859 1461 aa40.21■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.2■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
GKAP1-202ENST00000376365 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.19■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.17■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 KDM6BO15054 1643 aa40.14■■■■■ 4.02
GKAP1-202ENST00000376365 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
GKAP1-202ENST00000376365 AKNAQ7Z591 1439 aa40.11■■■■■ 4.01
GKAP1-202ENST00000376365 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 ADGRL1O94910 1474 aa40.04■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.01■■■■■ 4
GKAP1-202ENST00000376365 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.97■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.95■■■■□ 3.99
GKAP1-202ENST00000376365 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC1P33527 1531 aa39.93■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.92■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 MIA2Q96PC5 1412 aa39.92■■■■□ 3.98
GKAP1-202ENST00000376365 RAPGEF3O95398 923 aa39.88■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 RICTORQ6R327 1708 aa39.87■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.86■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.84■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.83■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.83■■■■□ 3.97
GKAP1-202ENST00000376365 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.82■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.82■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.8■■■■□ 3.96
GKAP1-202ENST00000376365 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.75■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 AFAP1Q8N556 730 aa39.74■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.71■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 KDM5CP41229 1560 aa39.7■■■■□ 3.95
GKAP1-202ENST00000376365 MBD5Q9P267 1494 aa39.69■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.66■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.65■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.63■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.63■■■■□ 3.94
GKAP1-202ENST00000376365 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.59■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.58■■■■□ 3.93
GKAP1-202ENST00000376365 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 TSPY4P0CV99 314 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 TSPY10P0CW01 314 aa39.55■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.52■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 ATP7AQ04656 1500 aa39.51■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.51■■■■□ 3.92
GKAP1-202ENST00000376365 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.49■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 DAPK1P53355 1430 aa39.48■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 ABCC5O15440 1437 aa39.47■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.45■■■■□ 3.91
GKAP1-202ENST00000376365 ABCA6Q8N139 1617 aa39.44■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.43■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 ATP10AO60312 1499 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.42■■■■□ 3.9
GKAP1-202ENST00000376365 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.34■■■■□ 3.89
GKAP1-202ENST00000376365 ITGAEP38570 1179 aa39.34■■■■□ 3.89
GKAP1-202ENST00000376365 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.31■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 PLXNC1O60486 1568 aa39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 REREQ9P2R6 1566 aa39.29■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 A2MP01023 1474 aa39.26■■■■□ 3.88
GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.25■■■■□ 3.87
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GKAP1-202ENST00000376365 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.22■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 ADGRL2O95490 1459 aa39.2■■■■□ 3.87
GKAP1-202ENST00000376365 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.19■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 KIF15Q9NS87 1388 aa39.19■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
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GKAP1-202ENST00000376365 AGLP35573 1532 aa39.16■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.15■■■■□ 3.86
GKAP1-202ENST00000376365 ROCK1Q13464 1354 aa39.13■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.09■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 MLECQ14165 292 aa39.08■■■■□ 3.85
GKAP1-202ENST00000376365 ERBINQ96RT1 1412 aa39.03■■■■□ 3.84
GKAP1-202ENST00000376365 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
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GKAP1-202ENST00000376365 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.97■■■■□ 3.83
GKAP1-202ENST00000376365 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.96■■■■□ 3.83
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GKAP1-202ENST00000376365 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.93■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 MADDQ8WXG6 1647 aa38.91■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
GKAP1-202ENST00000376365 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
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