RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
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GGTA1P-201ENST00000373793 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
GGTA1P-201ENST00000373793 FANCAO15360 1455 aa40.81■■■■■ 4.12
GGTA1P-201ENST00000373793 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.79■■■■■ 4.12
GGTA1P-201ENST00000373793 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.79■■■■■ 4.12
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
GGTA1P-201ENST00000373793 MIA2Q96PC5 1412 aa40.75■■■■■ 4.11
GGTA1P-201ENST00000373793 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.75■■■■■ 4.11
GGTA1P-201ENST00000373793 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.75■■■■■ 4.11
GGTA1P-201ENST00000373793 NEO1Q92859 1461 aa40.71■■■■■ 4.11
GGTA1P-201ENST00000373793 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.7■■■■■ 4.11
GGTA1P-201ENST00000373793 AKNAQ7Z591 1439 aa40.68■■■■■ 4.1
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.68■■■■■ 4.1
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
GGTA1P-201ENST00000373793 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.64■■■■■ 4.1
GGTA1P-201ENST00000373793 ADGRL1O94910 1474 aa40.62■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCC1P33527 1531 aa40.6■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.58■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
GGTA1P-201ENST00000373793 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.56■■■■■ 4.08
GGTA1P-201ENST00000373793 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.54■■■■■ 4.08
GGTA1P-201ENST00000373793 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.53■■■■■ 4.08
GGTA1P-201ENST00000373793 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.52■■■■■ 4.08
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
GGTA1P-201ENST00000373793 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
GGTA1P-201ENST00000373793 MBD5Q9P267 1494 aa40.46■■■■■ 4.07
GGTA1P-201ENST00000373793 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.43■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.41■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 KDM6BO15054 1643 aa40.41■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 RAPGEF3O95398 923 aa40.41■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.4■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 RICTORQ6R327 1708 aa40.39■■■■■ 4.06
GGTA1P-201ENST00000373793 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 AFAP1Q8N556 730 aa40.37■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.37■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.37■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.37■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.34■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 DAPK1P53355 1430 aa40.33■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCC5O15440 1437 aa40.32■■■■■ 4.05
GGTA1P-201ENST00000373793 ITGAEP38570 1179 aa40.31■■■■■ 4.04
GGTA1P-201ENST00000373793 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.29■■■■■ 4.04
GGTA1P-201ENST00000373793 KDM5CP41229 1560 aa40.28■■■■■ 4.04
GGTA1P-201ENST00000373793 TSPY4P0CV99 314 aa40.26■■■■■ 4.04
GGTA1P-201ENST00000373793 TSPY10P0CW01 314 aa40.26■■■■■ 4.04
GGTA1P-201ENST00000373793 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.21■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.21■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.2■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPRKQ15262 1439 aa40.2■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.2■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.2■■■■■ 4.03
GGTA1P-201ENST00000373793 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.18■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.17■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.16■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP7AQ04656 1500 aa40.15■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.15■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.14■■■■■ 4.02
GGTA1P-201ENST00000373793 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.13■■■■■ 4.01
GGTA1P-201ENST00000373793 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.1■■■■■ 4.01
GGTA1P-201ENST00000373793 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.1■■■■■ 4.01
GGTA1P-201ENST00000373793 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.06■■■■■ 4
GGTA1P-201ENST00000373793 ADGRL2O95490 1459 aa40.04■■■■■ 4
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GGTA1P-201ENST00000373793 ABCA6Q8N139 1617 aa40.03■■■■■ 4
GGTA1P-201ENST00000373793 PLXNC1O60486 1568 aa40.02■■■■■ 4
GGTA1P-201ENST00000373793 NCOA1Q15788 1441 aa40.01■■■■□ 3.99
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GGTA1P-201ENST00000373793 ROCK1Q13464 1354 aa40■■■■□ 3.99
GGTA1P-201ENST00000373793 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.99■■■■□ 3.99
GGTA1P-201ENST00000373793 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.99■■■■□ 3.99
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF15Q9NS87 1388 aa39.95■■■■□ 3.99
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP10AO60312 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
GGTA1P-201ENST00000373793 A2MP01023 1474 aa39.88■■■■□ 3.97
GGTA1P-201ENST00000373793 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.87■■■■□ 3.97
GGTA1P-201ENST00000373793 HFM1A2PYH4 1435 aa39.84■■■■□ 3.97
GGTA1P-201ENST00000373793 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.83■■■■□ 3.97
GGTA1P-201ENST00000373793 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.83■■■■□ 3.97
GGTA1P-201ENST00000373793 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
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GGTA1P-201ENST00000373793 REREQ9P2R6 1566 aa39.8■■■■□ 3.96
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GGTA1P-201ENST00000373793 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.75■■■■□ 3.95
GGTA1P-201ENST00000373793 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.7■■■■□ 3.95
GGTA1P-201ENST00000373793 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
GGTA1P-201ENST00000373793 AGLP35573 1532 aa39.68■■■■□ 3.94
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF3BO15066 747 aa39.67■■■■□ 3.94
GGTA1P-201ENST00000373793 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
GGTA1P-201ENST00000373793 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.64■■■■□ 3.94
GGTA1P-201ENST00000373793 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.6■■■■□ 3.93
GGTA1P-201ENST00000373793 GGT6Q6P531 493 aa39.55■■■■□ 3.92
GGTA1P-201ENST00000373793 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
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