RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373459.4

VSTM2L-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2 like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VSTM2L, Length 831 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2L-201ENST00000373459 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.13■■■■□ 3.53
VSTM2L-201ENST00000373459 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.12■■■■□ 3.53
VSTM2L-201ENST00000373459 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.11■■■■□ 3.53
VSTM2L-201ENST00000373459 PREX2Q70Z35 1606 aa37.09■■■■□ 3.53
VSTM2L-201ENST00000373459 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.08■■■■□ 3.53
VSTM2L-201ENST00000373459 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.02■■■■□ 3.52
VSTM2L-201ENST00000373459 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
VSTM2L-201ENST00000373459 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37■■■■□ 3.51
VSTM2L-201ENST00000373459 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37■■■■□ 3.51
VSTM2L-201ENST00000373459 TIAM1Q13009 1591 aa36.96■■■■□ 3.51
VSTM2L-201ENST00000373459 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.94■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.93■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 AFAP1Q8N556 730 aa36.92■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.92■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.92■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 ABCC1P33527 1531 aa36.9■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.9■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.9■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.89■■■■□ 3.5
VSTM2L-201ENST00000373459 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.86■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.85■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.84■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 KDM5CP41229 1560 aa36.84■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 MAP3K1Q13233 1512 aa36.84■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.83■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
VSTM2L-201ENST00000373459 NCOA2Q15596 1464 aa36.82■■■■□ 3.48
VSTM2L-201ENST00000373459 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
VSTM2L-201ENST00000373459 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
VSTM2L-201ENST00000373459 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.48
VSTM2L-201ENST00000373459 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.75■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.74■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 ATP10AO60312 1499 aa36.74■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.73■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.73■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.73■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.73■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.72■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.71■■■■□ 3.47
VSTM2L-201ENST00000373459 APLP2Q06481 763 aa36.68■■■■□ 3.46
VSTM2L-201ENST00000373459 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.68■■■■□ 3.46
VSTM2L-201ENST00000373459 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.65■■■■□ 3.46
VSTM2L-201ENST00000373459 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.64■■■■□ 3.46
VSTM2L-201ENST00000373459 ABCA6Q8N139 1617 aa36.63■■■■□ 3.45
VSTM2L-201ENST00000373459 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
VSTM2L-201ENST00000373459 MBD5Q9P267 1494 aa36.59■■■■□ 3.45
VSTM2L-201ENST00000373459 MADDQ8WXG6 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
VSTM2L-201ENST00000373459 MLECQ14165 292 aa36.57■■■■□ 3.44
VSTM2L-201ENST00000373459 REREQ9P2R6 1566 aa36.54■■■■□ 3.44
VSTM2L-201ENST00000373459 PTPRMP28827 1452 aa36.54■■■■□ 3.44
VSTM2L-201ENST00000373459 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.54■■■■□ 3.44
VSTM2L-201ENST00000373459 ATP7AQ04656 1500 aa36.5■■■■□ 3.43
VSTM2L-201ENST00000373459 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
VSTM2L-201ENST00000373459 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.49■■■■□ 3.43
VSTM2L-201ENST00000373459 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
VSTM2L-201ENST00000373459 AGLP35573 1532 aa36.44■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 MIA2Q96PC5 1412 aa36.43■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.43■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.43■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.42■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.39■■■■□ 3.42
VSTM2L-201ENST00000373459 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.38■■■■□ 3.41
VSTM2L-201ENST00000373459 A2MP01023 1474 aa36.35■■■■□ 3.41
VSTM2L-201ENST00000373459 PLXNC1O60486 1568 aa36.32■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.31■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.31■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 TSPY4P0CV99 314 aa36.29■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 TSPY10P0CW01 314 aa36.29■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.26■■■■□ 3.4
VSTM2L-201ENST00000373459 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.25■■■■□ 3.39
VSTM2L-201ENST00000373459 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
VSTM2L-201ENST00000373459 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
VSTM2L-201ENST00000373459 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.19■■■■□ 3.38
VSTM2L-201ENST00000373459 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
VSTM2L-201ENST00000373459 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
VSTM2L-201ENST00000373459 GGT6Q6P531 493 aa36.15■■■■□ 3.38
VSTM2L-201ENST00000373459 ABCC5O15440 1437 aa36.14■■■■□ 3.38
VSTM2L-201ENST00000373459 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.11■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 C3P01024 1663 aa36.1■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 KIF3BO15066 747 aa36.09■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.09■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 DAPK1P53355 1430 aa36.08■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.07■■■■□ 3.37
VSTM2L-201ENST00000373459 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.05■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.04■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 MROH2AA6NES4 1674 aa36.03■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 ZMYM3Q14202 1370 aa36.02■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
VSTM2L-201ENST00000373459 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.96■■■■□ 3.35
VSTM2L-201ENST00000373459 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.96■■■■□ 3.35
VSTM2L-201ENST00000373459 HSPA2P54652 639 aa35.95■■■■□ 3.35
VSTM2L-201ENST00000373459 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms