RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369642.7

RHOC-208, Transcript of ras homolog family member C, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOC-208	ENST00000369642	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		42.94	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.92	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.9	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.9	■■■■■ 4.46
RHOC-208	ENST00000369642	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.86	■■■■■ 4.45
RHOC-208	ENST00000369642	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.84	■■■■■ 4.45
RHOC-208	ENST00000369642	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
RHOC-208	ENST00000369642	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RHOC-208	ENST00000369642	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.81	■■■■■ 4.44
RHOC-208	ENST00000369642	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.79	■■■■■ 4.44
RHOC-208	ENST00000369642	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
RHOC-208	ENST00000369642	ABCC1	P33527	1531 aa		42.76	■■■■■ 4.44
RHOC-208	ENST00000369642	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.75	■■■■■ 4.43
RHOC-208	ENST00000369642	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.72	■■■■■ 4.43
RHOC-208	ENST00000369642	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.72	■■■■■ 4.43
RHOC-208	ENST00000369642	APLP2	Q06481	763 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RHOC-208	ENST00000369642	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.69	■■■■■ 4.43
RHOC-208	ENST00000369642	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
RHOC-208	ENST00000369642	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RHOC-208	ENST00000369642	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.63	■■■■■ 4.42
RHOC-208	ENST00000369642	KDM5C	P41229	1560 aa		42.63	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.6	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.6	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.59	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.58	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.57	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.57	■■■■■ 4.41
RHOC-208	ENST00000369642	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RHOC-208	ENST00000369642	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RHOC-208	ENST00000369642	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.49	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.46	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.45	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.45	■■■■■ 4.39
RHOC-208	ENST00000369642	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.43	■■■■■ 4.38
RHOC-208	ENST00000369642	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.41	■■■■■ 4.38
RHOC-208	ENST00000369642	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.39	■■■■■ 4.38
RHOC-208	ENST00000369642	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RHOC-208	ENST00000369642	ATP10A	O60312	1499 aa		42.35	■■■■■ 4.37
RHOC-208	ENST00000369642	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RHOC-208	ENST00000369642	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RHOC-208	ENST00000369642	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RHOC-208	ENST00000369642	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.31	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RHOC-208	ENST00000369642	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.25	■■■■■ 4.35
RHOC-208	ENST00000369642	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RHOC-208	ENST00000369642	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.23	■■■■■ 4.35
RHOC-208	ENST00000369642	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
RHOC-208	ENST00000369642	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RHOC-208	ENST00000369642	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.18	■■■■■ 4.34
RHOC-208	ENST00000369642	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RHOC-208	ENST00000369642	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
RHOC-208	ENST00000369642	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RHOC-208	ENST00000369642	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
RHOC-208	ENST00000369642	AGL	P35573	1532 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RHOC-208	ENST00000369642	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.05	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.05	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.03	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	A2M	P01023	1474 aa		42.02	■■■■■ 4.32
RHOC-208	ENST00000369642	TSPY4	P0CV99	314 aa		42	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	TSPY10	P0CW01	314 aa		42	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	ABCC5	O15440	1437 aa		41.99	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	MLEC	Q14165	292 aa		41.98	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.98	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.96	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	DAPK1	P53355	1430 aa		41.95	■■■■■ 4.31
RHOC-208	ENST00000369642	PTPRM	P28827	1452 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RHOC-208	ENST00000369642	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
RHOC-208	ENST00000369642	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RHOC-208	ENST00000369642	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.89	■■■■■ 4.3
RHOC-208	ENST00000369642	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
RHOC-208	ENST00000369642	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.73	■■■■■ 4.27
RHOC-208	ENST00000369642	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
RHOC-208	ENST00000369642	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RHOC-208	ENST00000369642	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RHOC-208	ENST00000369642	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.7	■■■■■ 4.27
RHOC-208	ENST00000369642	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.67	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.66	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.66	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.66	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	KIF3B	O15066	747 aa		41.65	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.65	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	GGT6	Q6P531	493 aa		41.64	■■■■■ 4.26
RHOC-208	ENST00000369642	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.63	■■■■■ 4.25
RHOC-208	ENST00000369642	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.61	■■■■■ 4.25
RHOC-208	ENST00000369642	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.61	■■■■■ 4.25
RHOC-208	ENST00000369642	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms