RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 AKNAQ7Z591 1439 aa25.26■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 NCOA2Q15596 1464 aa25.26■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.26■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.25■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.22■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 RICTORQ6R327 1708 aa25.22■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 ADGRL1O94910 1474 aa25.21■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.21■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 APLP2Q06481 763 aa25.21■■□□□ 1.63
PDSS2-201ENST00000369031 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.19■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.18■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC1P33527 1531 aa25.17■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.15■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 RAPGEF3O95398 923 aa25.14■■□□□ 1.62
PDSS2-201ENST00000369031 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.13■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.12■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.09■■□□□ 1.61
PDSS2-201ENST00000369031 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 KDM5CP41229 1560 aa25.05■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.04■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.02■■□□□ 1.6
PDSS2-201ENST00000369031 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.01■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.98■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.98■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 AFAP1Q8N556 730 aa24.98■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 22.4
PDSS2-201ENST00000369031 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.96■■□□□ 1.59
PDSS2-201ENST00000369031 MBD5Q9P267 1494 aa24.95■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 MIA2Q96PC5 1412 aa24.95■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA6Q8N139 1617 aa24.94■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.94■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.94■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.93■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.93■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.92■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.91■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.89■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.89■■□□□ 1.58
PDSS2-201ENST00000369031 ATP7AQ04656 1500 aa24.89■■□□□ 1.57
PDSS2-201ENST00000369031 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PDSS2-201ENST00000369031 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.86■■□□□ 1.57
PDSS2-201ENST00000369031 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.85■■□□□ 1.57
PDSS2-201ENST00000369031 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PDSS2-201ENST00000369031 ATP10AO60312 1499 aa24.83■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.82■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.81■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 REREQ9P2R6 1566 aa24.78■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.78■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.78■■□□□ 1.56
PDSS2-201ENST00000369031 DAPK1P53355 1430 aa24.75■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.74■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC5O15440 1437 aa24.74■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 PLXNC1O60486 1568 aa24.73■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.72■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.72■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.72■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.71■■□□□ 1.55
PDSS2-201ENST00000369031 MADDQ8WXG6 1647 aa24.7■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 A2MP01023 1474 aa24.7■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 AGLP35573 1532 aa24.67■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 TSPY4P0CV99 314 aa24.67■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 TSPY10P0CW01 314 aa24.67■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.66■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 MLECQ14165 292 aa24.65■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PDSS2-201ENST00000369031 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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PDSS2-201ENST00000369031 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.6■■□□□ 1.53
PDSS2-201ENST00000369031 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PDSS2-201ENST00000369031 ADGRL2O95490 1459 aa24.58■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 KIF15Q9NS87 1388 aa24.57■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.56■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 ITGAEP38570 1179 aa24.54■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.53■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 NCOA1Q15788 1441 aa24.52■■□□□ 1.52
PDSS2-201ENST00000369031 PTPRMP28827 1452 aa24.51■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 ERBINQ96RT1 1412 aa24.48■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 KIF3BO15066 747 aa24.47■■□□□ 1.51
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