RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362827.1

RNU6-446P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 446, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-446P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-446P-201ENST00000362827 LCE1DQ5T752 114 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADGRD1Q6QNK2 874 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 AXIN2Q9Y2T1 843 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa3.17□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 SGIP1Q9BQI5 828 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 G3V3G9 751 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 DCAF8Q5TAQ9 597 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 GPR153Q6NV75 609 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 POTEEQ6S8J3 1075 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-446P-201ENST00000362827 HRO43593 1189 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 PKDCCQ504Y2 493 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARSIQ5FYB1 569 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 IFNL1Q8IU54 200 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 COBLO75128 1261 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 MYT1Q01538 1121 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 LAMC2Q13753 1193 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 TK2O00142 265 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 GDF11O95390 407 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 Q8N3U1 123 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARHGAP33O14559 1287 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNMA1Q12791 1236 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 GOLGA2Q08379 1002 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-446P-201ENST00000362827 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 IGHA1P01876 353 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNC4Q03721 635 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 V9GY48 417 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 ADAM23O75077 832 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 DGAT1O75907 488 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 EHMT2Q96KQ7 1210 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 BOLA1Q9Y3E2 137 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 RASSF7Q02833 373 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 TERTO14746 1132 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 LCE2CQ5TA81 110 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 WNT2BQ93097 391 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-446P-201ENST00000362827 GSK3AP49840 483 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 DMRTA1Q5VZB9 504 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 RASEFQ8IZ41 740 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 ST8SIA5O15466 376 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 PSEN2P49810 448 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 DPY19L2Q6NUT2 758 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 SLC16A10Q8TF71 515 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 LHX6Q9UPM6 363 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 FAM187AA6NFU0 413 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 NUDT7P0C024 238 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 GMPRP36959 345 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 AAASQ9NRG9 546 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-446P-201ENST00000362827 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 FOXK2Q01167 660 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNH8Q96L42 1107 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 DACH1Q9UI36 760 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-446P-201ENST00000362827 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 ATXN8OSP0DMR3 200 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 IRF7Q92985 503 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 PPP1R18Q6NYC8 613 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 FOXD4L1Q9NU39 408 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 MSTNO14793 375 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 PLEKHG5O94827 1062 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 NYAP1Q6ZVC0 841 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 TRIM67Q6ZTA4 783 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 PCDHB8Q9UN66 801 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 FZD5Q13467 585 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 TMEM92Q6UXU6 159 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 KCNK17Q96T54 332 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-446P-201ENST00000362827 AXIN1O15169 862 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 GALNT6Q8NCL4 622 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 ANKK1Q8NFD2 765 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 IRS1P35568 1242 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-446P-201ENST00000362827 PRR20EP86478 221 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms