RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 CD109Q6YHK3 1445 aa10.74□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 KIF14Q15058 1648 aa10.73□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa10.73□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.72□□□□□ -0.69
CCR6-202ENST00000349984 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.71□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 CEP162Q5TB80 1403 aa10.71□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 FMN1Q68DA7 1419 aa10.69□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.69□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.68□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 RAPGEF3O95398 923 aa10.68□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.67□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.65□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.65□□□□□ -0.7
CCR6-202ENST00000349984 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.64□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.64□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa10.63□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 PREX2Q70Z35 1606 aa10.62□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.62□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 PKNOX2Q96KN3 472 aa10.62□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa10.62□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 NEO1Q92859 1461 aa10.61□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 FANCAO15360 1455 aa10.61□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.61□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 MROH2AA6NES4 1674 aa10.6□□□□□ -0.71
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CCR6-202ENST00000349984 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa10.59□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.59□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 RICTORQ6R327 1708 aa10.59□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.59□□□□□ -0.71
CCR6-202ENST00000349984 AKNAQ7Z591 1439 aa10.58□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 MAGI2Q86UL8 1455 aa10.58□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 KDM5CP41229 1560 aa10.58□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ARHGAP5Q13017 1502 aa10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ADGRL1O94910 1474 aa10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 YEATS2Q9ULM3 1422 aa10.56□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 PLCH2O75038 1416 aa10.56□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa10.56□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 AFAP1Q8N556 730 aa10.55□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 SCAPERQ9BY12 1400 aa10.55□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 PLXNC1O60486 1568 aa10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 AGLP35573 1532 aa10.53□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CCR6-202ENST00000349984 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.52□□□□□ -0.72
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CCR6-202ENST00000349984 TIAM1Q13009 1591 aa10.52□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa10.51□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa10.51□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.51□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 MLECQ14165 292 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 POGZQ7Z3K3 1410 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 SYCP2Q9BX26 1530 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.5□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 ABCC1P33527 1531 aa10.49□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa10.49□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa10.49□□□□□ -0.73
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CCR6-202ENST00000349984 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 ABCA6Q8N139 1617 aa10.47□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.47□□□□□ -0.73
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CCR6-202ENST00000349984 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa10.47□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 NCOA2Q15596 1464 aa10.47□□□□□ -0.73
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CCR6-202ENST00000349984 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.46□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.46□□□□□ -0.73
CCR6-202ENST00000349984 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.46□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 DEPDC5O75140 1603 aa10.45□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa10.45□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.45□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa10.45□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa10.44□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 HECW2Q9P2P5 1572 aa10.44□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.43□□□□□ -0.74
CCR6-202ENST00000349984 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.43□□□□□ -0.74
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