RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.66■■□□□ 1.7
ATG4B-201ENST00000344376 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.65■■□□□ 1.7
ATG4B-201ENST00000344376 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.64■■□□□ 1.7
ATG4B-201ENST00000344376 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 PREX2Q70Z35 1606 aa25.62■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.62■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.6■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.58■■□□□ 1.69
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.58■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.56■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.55■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 ABCC1P33527 1531 aa25.52■■□□□ 1.68
ATG4B-201ENST00000344376 KDM5CP41229 1560 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 AFAP1Q8N556 730 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 ATP10AO60312 1499 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 TIAM1Q13009 1591 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-201ENST00000344376 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.39■■□□□ 1.66
ATG4B-201ENST00000344376 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 MADDQ8WXG6 1647 aa25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 PTPRMP28827 1452 aa25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 NCOA2Q15596 1464 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 MAP3K1Q13233 1512 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.651e-6■■■■□ 21.8
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 MLECQ14165 292 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-201ENST00000344376 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 ABCA6Q8N139 1617 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 REREQ9P2R6 1566 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 APLP2Q06481 763 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-201ENST00000344376 ATP7AQ04656 1500 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 AGLP35573 1532 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 MBD5Q9P267 1494 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-201ENST00000344376 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 A2MP01023 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 MIA2Q96PC5 1412 aa25.14■■□□□ 1.62
ATG4B-201ENST00000344376 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 PLXNC1O60486 1568 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 TSPY4P0CV99 314 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 TSPY10P0CW01 314 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-201ENST00000344376 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.07■■□□□ 1.6
ATG4B-201ENST00000344376 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-201ENST00000344376 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-201ENST00000344376 GGT6Q6P531 493 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 C3P01024 1663 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 MROH2AA6NES4 1674 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.95■■□□□ 1.59
ATG4B-201ENST00000344376 KIF3BO15066 747 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 HSPA2P54652 639 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 ZMYM3Q14202 1370 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 NPATQ14207 1427 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-201ENST00000344376 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 ABCC5O15440 1437 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.88■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 DAPK1P53355 1430 aa24.87■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ATG4B-201ENST00000344376 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms