RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339209.8

PHF10-201, Transcript of PHD finger protein 10, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHF10, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF10-201ENST00000339209 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
PHF10-201ENST00000339209 FGD6Q6ZV73 1430 aa49.76■■■■■ 5.56
PHF10-201ENST00000339209 ARAP3Q8WWN8 1544 aa49.75■■■■■ 5.55
PHF10-201ENST00000339209 MIA2Q96PC5 1412 aa49.72■■■■■ 5.55
PHF10-201ENST00000339209 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.55
PHF10-201ENST00000339209 PTPN23Q9H3S7 1636 aa49.69■■■■■ 5.54
PHF10-201ENST00000339209 FANCAO15360 1455 aa49.66■■■■■ 5.54
PHF10-201ENST00000339209 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP49.65■■■■■ 5.54
PHF10-201ENST00000339209 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.54
PHF10-201ENST00000339209 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa49.61■■■■■ 5.53
PHF10-201ENST00000339209 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa49.61■■■■■ 5.53
PHF10-201ENST00000339209 CFAP74Q9C0B2 1584 aa49.6■■■■■ 5.53
PHF10-201ENST00000339209 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa49.59■■■■■ 5.53
PHF10-201ENST00000339209 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP49.59■■■■■ 5.53
PHF10-201ENST00000339209 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
PHF10-201ENST00000339209 TEX14Q8IWB6 1497 aa49.53■■■■■ 5.52
PHF10-201ENST00000339209 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
PHF10-201ENST00000339209 NEO1Q92859 1461 aa49.48■■■■■ 5.51
PHF10-201ENST00000339209 AKNAQ7Z591 1439 aa49.47■■■■■ 5.51
PHF10-201ENST00000339209 ABCC1P33527 1531 aa49.46■■■■■ 5.51
PHF10-201ENST00000339209 SYCP2Q9BX26 1530 aa49.44■■■■■ 5.5
PHF10-201ENST00000339209 ADGRL1O94910 1474 aa49.43■■■■■ 5.5
PHF10-201ENST00000339209 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa49.42■■■■■ 5.5
PHF10-201ENST00000339209 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP49.38■■■■■ 5.54e-13■■■□□ 17
PHF10-201ENST00000339209 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa49.36■■■■■ 5.49
PHF10-201ENST00000339209 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa49.35■■■■■ 5.49
PHF10-201ENST00000339209 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP49.34■■■■■ 5.492e-6■■■□□ 18.5
PHF10-201ENST00000339209 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.32■■■■■ 5.49
PHF10-201ENST00000339209 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.32■■■■■ 5.49
PHF10-201ENST00000339209 MBD5Q9P267 1494 aa49.3■■■■■ 5.48
PHF10-201ENST00000339209 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
PHF10-201ENST00000339209 ARHGEF5Q12774 1597 aa49.29■■■■■ 5.48
PHF10-201ENST00000339209 ITGAEP38570 1179 aa49.24■■■■■ 5.47
PHF10-201ENST00000339209 CROCC2H7BZ55 1655 aa49.22■■■■■ 5.47
PHF10-201ENST00000339209 DAPK1P53355 1430 aa49.22■■■■■ 5.47
PHF10-201ENST00000339209 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa49.22■■■■■ 5.47
PHF10-201ENST00000339209 CCDC141Q6ZP82 1450 aa49.21■■■■■ 5.47
PHF10-201ENST00000339209 ABCC5O15440 1437 aa49.19■■■■■ 5.46
PHF10-201ENST00000339209 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.18■■■■■ 5.46
PHF10-201ENST00000339209 POGZQ7Z3K3 1410 aa49.16■■■■■ 5.46
PHF10-201ENST00000339209 RICTORQ6R327 1708 aa49.16■■■■■ 5.46
PHF10-201ENST00000339209 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa49.13■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 RSPH4AQ5TD94 716 aa49.12■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 AFAP1Q8N556 730 aa49.12■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 PTPRKQ15262 1439 aa49.1■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 RAPGEF3O95398 923 aa49.09■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa49.09■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
PHF10-201ENST00000339209 KDM5CP41229 1560 aa49.05■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 SHANK2Q9UPX8 1470 aa49.04■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 KDM6BO15054 1643 aa49.03■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 TSPY4P0CV99 314 aa49.03■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 TSPY10P0CW01 314 aa49.03■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 C9orf84Q5VXU9 1444 aa49.02■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 CHIC2Q9UKJ5 165 aa49.01■■■■■ 5.44
PHF10-201ENST00000339209 ADGBQ8N7X0 1667 aa48.99■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 MAST1Q9Y2H9 1570 aa48.99■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP48.95■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP48.95■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 PCGF6Q9BYE7 350 aa48.95■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa48.94■■■■■ 5.43
PHF10-201ENST00000339209 HECW2Q9P2P5 1572 aa48.94■■■■■ 5.42
PHF10-201ENST00000339209 ATP7AQ04656 1500 aa48.92■■■■■ 5.42
PHF10-201ENST00000339209 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.91■■■■■ 5.42
PHF10-201ENST00000339209 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa48.89■■■■■ 5.42
PHF10-201ENST00000339209 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.89■■■■■ 5.42
PHF10-201ENST00000339209 ADGRL2O95490 1459 aa48.86■■■■■ 5.41
PHF10-201ENST00000339209 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.86■■■■■ 5.41
PHF10-201ENST00000339209 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa48.85■■■■■ 5.41
PHF10-201ENST00000339209 PLXNC1O60486 1568 aa48.82■■■■■ 5.41
PHF10-201ENST00000339209 ROCK1Q13464 1354 aa48.81■■■■■ 5.4
PHF10-201ENST00000339209 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.81■■■■■ 5.4
PHF10-201ENST00000339209 NCOA1Q15788 1441 aa48.8■■■■■ 5.4
PHF10-201ENST00000339209 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa48.78■■■■■ 5.4
PHF10-201ENST00000339209 ABCA6Q8N139 1617 aa48.75■■■■■ 5.39
PHF10-201ENST00000339209 MAGI2Q86UL8 1455 aa48.74■■■■■ 5.39
PHF10-201ENST00000339209 YEATS2Q9ULM3 1422 aa48.72■■■■■ 5.39
PHF10-201ENST00000339209 GCC2Q8IWJ2 1684 aa48.72■■■■■ 5.39
PHF10-201ENST00000339209 KIF15Q9NS87 1388 aa48.71■■■■■ 5.39
PHF10-201ENST00000339209 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.69■■■■■ 5.38
PHF10-201ENST00000339209 HFM1A2PYH4 1435 aa48.69■■■■■ 5.38
PHF10-201ENST00000339209 NAIPQ13075 1403 aa48.65■■■■■ 5.38
PHF10-201ENST00000339209 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.64■■■■■ 5.38
PHF10-201ENST00000339209 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.6■■■■■ 5.37
PHF10-201ENST00000339209 SETD5Q9C0A6 1442 aa48.54■■■■■ 5.36
PHF10-201ENST00000339209 A2MP01023 1474 aa48.54■■■■■ 5.36
PHF10-201ENST00000339209 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa48.52■■■■■ 5.36
PHF10-201ENST00000339209 ATP10AO60312 1499 aa48.51■■■■■ 5.36
PHF10-201ENST00000339209 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
PHF10-201ENST00000339209 ERBINQ96RT1 1412 aa48.46■■■■■ 5.35
PHF10-201ENST00000339209 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa48.44■■■■■ 5.35
PHF10-201ENST00000339209 REREQ9P2R6 1566 aa48.42■■■■■ 5.34
PHF10-201ENST00000339209 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
PHF10-201ENST00000339209 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa48.39■■■■■ 5.34
PHF10-201ENST00000339209 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.3■■■■■ 5.32
PHF10-201ENST00000339209 KIF3BO15066 747 aa48.28■■■■■ 5.32
PHF10-201ENST00000339209 AGLP35573 1532 aa48.25■■■■■ 5.31
PHF10-201ENST00000339209 DEPDC5O75140 1603 aa48.22■■■■■ 5.31
PHF10-201ENST00000339209 UNC13BO14795 1591 aa48.21■■■■■ 5.31
PHF10-201ENST00000339209 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms