RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339083.11

RHOC-202, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOC-202ENST00000339083 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.94■■■■■ 4.14
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RHOC-202ENST00000339083 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.92■■■■■ 4.14
RHOC-202ENST00000339083 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.92■■■■■ 4.14
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RHOC-202ENST00000339083 TIAM1Q13009 1591 aa40.9■■■■■ 4.14
RHOC-202ENST00000339083 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.9■■■■■ 4.14
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RHOC-202ENST00000339083 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.72■■■■■ 4.11
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RHOC-202ENST00000339083 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.66■■■■■ 4.1
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RHOC-202ENST00000339083 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.6■■■■■ 4.09
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RHOC-202ENST00000339083 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.51■■■■■ 4.08
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RHOC-202ENST00000339083 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.5■■■■■ 4.07
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RHOC-202ENST00000339083 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
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RHOC-202ENST00000339083 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
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RHOC-202ENST00000339083 MADDQ8WXG6 1647 aa40.41■■■■■ 4.06
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RHOC-202ENST00000339083 REREQ9P2R6 1566 aa40.39■■■■■ 4.06
RHOC-202ENST00000339083 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
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RHOC-202ENST00000339083 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.34■■■■■ 4.05
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RHOC-202ENST00000339083 MLECQ14165 292 aa40.21■■■■■ 4.03
RHOC-202ENST00000339083 PLXNC1O60486 1568 aa40.16■■■■■ 4.02
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RHOC-202ENST00000339083 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.14■■■■■ 4.02
RHOC-202ENST00000339083 A2MP01023 1474 aa40.1■■■■■ 4.01
RHOC-202ENST00000339083 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.09■■■■■ 4.01
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RHOC-202ENST00000339083 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.06■■■■■ 4
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RHOC-202ENST00000339083 TSPY10P0CW01 314 aa39.92■■■■□ 3.98
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RHOC-202ENST00000339083 C3P01024 1663 aa39.88■■■■□ 3.98
RHOC-202ENST00000339083 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.87■■■■□ 3.97
RHOC-202ENST00000339083 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.85■■■■□ 3.97
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RHOC-202ENST00000339083 MROH2AA6NES4 1674 aa39.82■■■■□ 3.97
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RHOC-202ENST00000339083 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
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RHOC-202ENST00000339083 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
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RHOC-202ENST00000339083 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.65■■■■□ 3.94
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