RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.48■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.48■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 PLCH2O75038 1416 aa29.45■■■□□ 2.31
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.45■■■□□ 2.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
VSTM2B-201ENST00000335523 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.43■■■□□ 2.3
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.41■■■□□ 2.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.39■■■□□ 2.3
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.38■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 PREX2Q70Z35 1606 aa29.37■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.36■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.35■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CD109Q6YHK3 1445 aa29.34■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.33■■■□□ 2.29
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM2B-201ENST00000335523 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
VSTM2B-201ENST00000335523 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.27■■■□□ 2.28
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC5O15440 1437 aa29.26■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 DAPK1P53355 1430 aa29.26■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPRKQ15262 1439 aa29.25■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPOAP1O95153 1857 aa29.25■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 FANCAO15360 1455 aa29.25■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPY4P0CV99 314 aa29.24■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPY10P0CW01 314 aa29.24■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.23■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.22■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 MBD5Q9P267 1494 aa29.2■■■□□ 2.27
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.17■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 ROCK1Q13464 1354 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 AKNAQ7Z591 1439 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.16■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.15■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.14■■■□□ 2.26
VSTM2B-201ENST00000335523 KDM6BO15054 1643 aa29.14■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.12■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 NEO1Q92859 1461 aa29.12■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC1P33527 1531 aa29.12■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 HRCP23327 699 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 HFM1A2PYH4 1435 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRL1O94910 1474 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.1■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NAIPQ13075 1403 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 NCOA1Q15788 1441 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 AFAP1Q8N556 730 aa29.05■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRL2O95490 1459 aa29.04■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
VSTM2B-201ENST00000335523 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.01■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.97■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.96■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.95■■■□□ 2.23
VSTM2B-201ENST00000335523 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.95■■■□□ 2.22
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.94■■■□□ 2.22
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF15Q9NS87 1388 aa28.94■■■□□ 2.22
VSTM2B-201ENST00000335523 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM2B-201ENST00000335523 RAPGEF3O95398 923 aa28.89■■■□□ 2.22
VSTM2B-201ENST00000335523 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.89■■■□□ 2.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.88■■■□□ 2.21
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM52Q96A61 297 aa28.84■■■□□ 2.21
VSTM2B-201ENST00000335523 PLXNC1O60486 1568 aa28.83■■■□□ 2.21
VSTM2B-201ENST00000335523 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.83■■■□□ 2.21
VSTM2B-201ENST00000335523 ATP7AQ04656 1500 aa28.81■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.81■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 KDM5CP41229 1560 aa28.81■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.79■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
VSTM2B-201ENST00000335523 ERBINQ96RT1 1412 aa28.74■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.74■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.72■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 RICTORQ6R327 1708 aa28.71■■■□□ 2.19
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.7■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.7■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.68■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 NUP155O75694 1391 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 A2MP01023 1474 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF3BO15066 747 aa28.62■■■□□ 2.17
VSTM2B-201ENST00000335523 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
VSTM2B-201ENST00000335523 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms