RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328739.5

VMO1-201, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-201ENST00000328739 AKNAQ7Z591 1439 aa30.72■■■□□ 2.51
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VMO1-201ENST00000328739 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
VMO1-201ENST00000328739 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
VMO1-201ENST00000328739 PREX2Q70Z35 1606 aa30.68■■■□□ 2.5
VMO1-201ENST00000328739 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.67■■■□□ 2.5
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VMO1-201ENST00000328739 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.66■■■□□ 2.5
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VMO1-201ENST00000328739 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.62■■■□□ 2.49
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VMO1-201ENST00000328739 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.54■■■□□ 2.48
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VMO1-201ENST00000328739 TSPY10P0CW01 314 aa30.21■■■□□ 2.43
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VMO1-201ENST00000328739 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.73■■■□□ 2.35
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VMO1-201ENST00000328739 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
VMO1-201ENST00000328739 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
VMO1-201ENST00000328739 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
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