RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.71■■■□□ 2.51
PUS1-201ENST00000322060 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
PUS1-201ENST00000322060 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.64■■■□□ 2.5
PUS1-201ENST00000322060 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
PUS1-201ENST00000322060 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
PUS1-201ENST00000322060 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.6■■■□□ 2.49
PUS1-201ENST00000322060 ATP10AO60312 1499 aa30.59■■■□□ 2.49
PUS1-201ENST00000322060 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.59■■■□□ 2.49
PUS1-201ENST00000322060 CLIP1P30622 1438 aa30.57■■■□□ 2.48
PUS1-201ENST00000322060 FBXO41Q8TF61 875 aa30.57■■■□□ 2.48
PUS1-201ENST00000322060 KIF14Q15058 1648 aa30.57■■■□□ 2.48
PUS1-201ENST00000322060 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.54■■■□□ 2.48
PUS1-201ENST00000322060 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.53■■■□□ 2.48
PUS1-201ENST00000322060 MLECQ14165 292 aa30.51■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.5■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 AFAP1Q8N556 730 aa30.48■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.47■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.47■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.47■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 KDM5CP41229 1560 aa30.46■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.45■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 HSPA2P54652 639 aa30.45■■■□□ 2.47
PUS1-201ENST00000322060 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.44■■■□□ 2.46
PUS1-201ENST00000322060 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.44■■■□□ 2.46
PUS1-201ENST00000322060 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.39■■■□□ 2.46
PUS1-201ENST00000322060 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.39■■■□□ 2.45
PUS1-201ENST00000322060 REREQ9P2R6 1566 aa30.37■■■□□ 2.45
PUS1-201ENST00000322060 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.35■■■□□ 2.45
PUS1-201ENST00000322060 PREX2Q70Z35 1606 aa30.34■■■□□ 2.45
PUS1-201ENST00000322060 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.32■■■□□ 2.45
PUS1-201ENST00000322060 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.32■■■□□ 2.44
PUS1-201ENST00000322060 ABCC1P33527 1531 aa30.32■■■□□ 2.44
PUS1-201ENST00000322060 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.31■■■□□ 2.44
PUS1-201ENST00000322060 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PUS1-201ENST00000322060 AGLP35573 1532 aa30.28■■■□□ 2.44
PUS1-201ENST00000322060 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.26■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 ABCA6Q8N139 1617 aa30.25■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.23■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.22■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 CERKQ8TCT0 537 aa30.2■■■□□ 2.43
PUS1-201ENST00000322060 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.19■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.19■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.18■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.14■■■□□ 2.42
PUS1-201ENST00000322060 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.13■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.13■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 C3P01024 1663 aa30.11■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.1■■■□□ 2.418e-7■■□□□ 13
PUS1-201ENST00000322060 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.09■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 STRCQ7RTU9 1775 aa30.08■■■□□ 2.41
PUS1-201ENST00000322060 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.07■■■□□ 2.4
PUS1-201ENST00000322060 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.06■■■□□ 2.4
PUS1-201ENST00000322060 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.04■■■□□ 2.4
PUS1-201ENST00000322060 PTPRTO14522 1441 aa30.02■■■□□ 2.4
PUS1-201ENST00000322060 NPATQ14207 1427 aa30■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 ATP7AQ04656 1500 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 ZMYM3Q14202 1370 aa29.99■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 MROH2AA6NES4 1674 aa29.97■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 A2MP01023 1474 aa29.96■■■□□ 2.39
PUS1-201ENST00000322060 PLXNC1O60486 1568 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.94■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 NCOA1Q15788 1441 aa29.91■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 CEP162Q5TB80 1403 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.9■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 MBD5Q9P267 1494 aa29.89■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
PUS1-201ENST00000322060 TIAM1Q13009 1591 aa29.88■■■□□ 2.37
PUS1-201ENST00000322060 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.88■■■□□ 2.37
PUS1-201ENST00000322060 GGT6Q6P531 493 aa29.85■■■□□ 2.37
PUS1-201ENST00000322060 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.82■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 PTPRKQ15262 1439 aa29.81■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.81■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.81■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.79■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.77■■■□□ 2.36
PUS1-201ENST00000322060 PKD2Q13563 968 aa29.76■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 PLA2R1Q13018 1463 aa29.74■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 NCOA2Q15596 1464 aa29.73■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.72■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.71■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.71■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
PUS1-201ENST00000322060 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
PUS1-201ENST00000322060 KIF3BO15066 747 aa29.67■■■□□ 2.34
PUS1-201ENST00000322060 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.67■■■□□ 2.34
PUS1-201ENST00000322060 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.66■■■□□ 2.34
PUS1-201ENST00000322060 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.63■■■□□ 2.33
PUS1-201ENST00000322060 TSPY4P0CV99 314 aa29.62■■■□□ 2.33
PUS1-201ENST00000322060 TSPY10P0CW01 314 aa29.62■■■□□ 2.33
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