RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.6■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.57■■■■■ 4.25
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD109Q6YHK3 1445 aa41.55■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.54■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLI2P10070 1586 aa41.54■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.53■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIP2BQ9P265 1576 aa41.52■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.51■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGAEP38570 1179 aa41.5■■■■■ 4.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.5■■■■■ 4.23
CTDNEP1-201ENST00000318988 FANCAO15360 1455 aa41.42■■■■■ 4.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.4■■■■■ 4.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.39■■■■■ 4.22
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.38■■■■■ 4.21
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.32■■■■■ 4.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.31■■■■■ 4.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.29■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.27■■■■■ 4.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKNAQ7Z591 1439 aa41.26■■■■■ 4.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.26■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCC1P33527 1531 aa41.24■■■■■ 4.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRL1O94910 1474 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 MBD5Q9P267 1494 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.22■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPY4P0CV99 314 aa41.21■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPY10P0CW01 314 aa41.21■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.19■■■■■ 4.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPRKQ15262 1439 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.18■■■■■ 4.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.17■■■■■ 4.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPOAP1O95153 1857 aa41.16■■■■■ 4.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.15■■■■■ 4.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.09■■■■■ 4.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.09■■■■■ 4.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.08■■■■■ 4.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.08■■■■■ 4.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ROCK1Q13464 1354 aa41.04■■■■■ 4.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFAP1Q8N556 730 aa41.03■■■■■ 4.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.02■■■■■ 4.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.02■■■■■ 4.16
CTDNEP1-201ENST00000318988 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41■■■■■ 4.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 HFM1A2PYH4 1435 aa40.97■■■■■ 4.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.97■■■■■ 4.15
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRL2O95490 1459 aa40.97■■■■■ 4.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.95■■■■■ 4.15
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.89■■■■■ 4.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.85■■■■■ 4.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF15Q9NS87 1388 aa40.84■■■■■ 4.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.8■■■■■ 4.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXNC1O60486 1568 aa40.79■■■■■ 4.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RICTORQ6R327 1708 aa40.78■■■■■ 4.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.72■■■■■ 4.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.7■■■■■ 4.11
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM52Q96A61 297 aa40.59■■■■■ 4.09
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CTDNEP1-201ENST00000318988 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.52■■■■■ 4.08
CTDNEP1-201ENST00000318988 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.49■■■■■ 4.07
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP10AO60312 1499 aa40.44■■■■■ 4.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIF3BO15066 747 aa40.42■■■■■ 4.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP155O75694 1391 aa40.39■■■■■ 4.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.38■■■■■ 4.069e-7■■□□□ 12.2
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.38■■■■■ 4.05
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