RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.5■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.49■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 PREX2Q70Z35 1606 aa40.48■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.45■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.45■■■■■ 4.07
CTXN1-201ENST00000318978 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.38■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.37■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.35■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.33■■■■■ 4.05
CTXN1-201ENST00000318978 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.32■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 TIAM1Q13009 1591 aa40.31■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.3■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.27■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.26■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC1P33527 1531 aa40.25■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.24■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 AFAP1Q8N556 730 aa40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.23■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.22■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.22■■■■■ 4.03
CTXN1-201ENST00000318978 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.18■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 KDM5CP41229 1560 aa40.16■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.16■■■■■ 4.02
CTXN1-201ENST00000318978 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.13■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 NCOA2Q15596 1464 aa40.12■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 APLP2Q06481 763 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 MAP3K1Q13233 1512 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.11■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 ATP10AO60312 1499 aa40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.07■■■■■ 4.01
CTXN1-201ENST00000318978 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.05■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.03■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.03■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.02■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
CTXN1-201ENST00000318978 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.97■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA6Q8N139 1617 aa39.97■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 MADDQ8WXG6 1647 aa39.96■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 MLECQ14165 292 aa39.96■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.95■■■■□ 3.99
CTXN1-201ENST00000318978 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
CTXN1-201ENST00000318978 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
CTXN1-201ENST00000318978 PTPRMP28827 1452 aa39.87■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.87■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 ATP7AQ04656 1500 aa39.84■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 REREQ9P2R6 1566 aa39.84■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.82■■■■□ 3.97
CTXN1-201ENST00000318978 MBD5Q9P267 1494 aa39.81■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.76■■■■□ 3.96
CTXN1-201ENST00000318978 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.75■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.74■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 AGLP35573 1532 aa39.71■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.71■■■■□ 3.95
CTXN1-201ENST00000318978 MIA2Q96PC5 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.67■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.67■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 A2MP01023 1474 aa39.65■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.65■■■■□ 3.94
CTXN1-201ENST00000318978 TSPY4P0CV99 314 aa39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 TSPY10P0CW01 314 aa39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 PLXNC1O60486 1568 aa39.58■■■■□ 3.93
CTXN1-201ENST00000318978 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.57■■■■□ 3.92
CTXN1-201ENST00000318978 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.5■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 GGT6Q6P531 493 aa39.46■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.45■■■■□ 3.91
CTXN1-201ENST00000318978 C3P01024 1663 aa39.42■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.42■■■■□ 3.9
CTXN1-201ENST00000318978 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
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CTXN1-201ENST00000318978 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
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CTXN1-201ENST00000318978 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.36■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 MROH2AA6NES4 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC5O15440 1437 aa39.34■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
CTXN1-201ENST00000318978 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.32■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 DAPK1P53355 1430 aa39.31■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.3■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.28■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 ZMYM3Q14202 1370 aa39.27■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
CTXN1-201ENST00000318978 HSPA2P54652 639 aa39.22■■■■□ 3.87
CTXN1-201ENST00000318978 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.22■■■■□ 3.87
CTXN1-201ENST00000318978 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.22■■■■□ 3.87
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