RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318801.8

SYNGR1-202, Transcript of synaptogyrin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNGR1, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1-202ENST00000318801 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.27■■■■■ 5
SYNGR1-202ENST00000318801 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.21■■■■■ 4.99
SYNGR1-202ENST00000318801 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.19■■■■■ 4.99
SYNGR1-202ENST00000318801 PREX2Q70Z35 1606 aa46.19■■■■■ 4.98
SYNGR1-202ENST00000318801 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.18■■■■■ 4.98
SYNGR1-202ENST00000318801 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.16■■■■■ 4.98
SYNGR1-202ENST00000318801 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.14■■■■■ 4.98
SYNGR1-202ENST00000318801 CCNB3Q8WWL7 1395 aa46.13■■■■■ 4.98
SYNGR1-202ENST00000318801 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.12■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.12■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa46.1■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.1■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
SYNGR1-202ENST00000318801 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.06■■■■■ 4.96
SYNGR1-202ENST00000318801 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.06■■■■■ 4.96
SYNGR1-202ENST00000318801 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
SYNGR1-202ENST00000318801 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.06■■■■■ 4.96
SYNGR1-202ENST00000318801 AFAP1Q8N556 730 aa46.03■■■■■ 4.96
SYNGR1-202ENST00000318801 TIAM1Q13009 1591 aa45.98■■■■■ 4.95
SYNGR1-202ENST00000318801 APLP2Q06481 763 aa45.96■■■■■ 4.95
SYNGR1-202ENST00000318801 YEATS2Q9ULM3 1422 aa45.96■■■■■ 4.95
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCC1P33527 1531 aa45.95■■■■■ 4.95
SYNGR1-202ENST00000318801 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
SYNGR1-202ENST00000318801 KDM5CP41229 1560 aa45.89■■■■■ 4.94
SYNGR1-202ENST00000318801 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
SYNGR1-202ENST00000318801 ATP10AO60312 1499 aa45.88■■■■■ 4.94
SYNGR1-202ENST00000318801 MAP3K1Q13233 1512 aa45.87■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.87■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.86■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.85■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.83■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.83■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 HECW2Q9P2P5 1572 aa45.83■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP45.83■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.82■■■■■ 4.93
SYNGR1-202ENST00000318801 NCOA2Q15596 1464 aa45.82■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.82■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.8■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 C9orf84Q5VXU9 1444 aa45.8■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.77■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.76■■■■■ 4.92
SYNGR1-202ENST00000318801 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
SYNGR1-202ENST00000318801 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
SYNGR1-202ENST00000318801 MLECQ14165 292 aa45.69■■■■■ 4.9
SYNGR1-202ENST00000318801 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
SYNGR1-202ENST00000318801 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.63■■■■■ 4.9
SYNGR1-202ENST00000318801 PTPRMP28827 1452 aa45.62■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 MADDQ8WXG6 1647 aa45.62■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 RSPH4AQ5TD94 716 aa45.6■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa45.6■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCA6Q8N139 1617 aa45.59■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa45.58■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 REREQ9P2R6 1566 aa45.58■■■■■ 4.89
SYNGR1-202ENST00000318801 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa45.51■■■■■ 4.88
SYNGR1-202ENST00000318801 MBD5Q9P267 1494 aa45.51■■■■■ 4.88
SYNGR1-202ENST00000318801 ATP7AQ04656 1500 aa45.51■■■■■ 4.88
SYNGR1-202ENST00000318801 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
SYNGR1-202ENST00000318801 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
SYNGR1-202ENST00000318801 AGLP35573 1532 aa45.45■■■■■ 4.87
SYNGR1-202ENST00000318801 MYOM3Q5VTT5 1437 aa45.45■■■■■ 4.87
SYNGR1-202ENST00000318801 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.45■■■■■ 4.87
SYNGR1-202ENST00000318801 MIA2Q96PC5 1412 aa45.43■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP45.43■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 TSPY4P0CV99 314 aa45.43■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 TSPY10P0CW01 314 aa45.43■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 CCDC141Q6ZP82 1450 aa45.42■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.41■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 PLPPR3Q6T4P5 718 aa45.39■■■■■ 4.86
SYNGR1-202ENST00000318801 A2MP01023 1474 aa45.34■■■■■ 4.85
SYNGR1-202ENST00000318801 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.32■■■■■ 4.85
SYNGR1-202ENST00000318801 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.31■■■■■ 4.84
SYNGR1-202ENST00000318801 PLXNC1O60486 1568 aa45.2■■■■■ 4.83
SYNGR1-202ENST00000318801 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.83
SYNGR1-202ENST00000318801 CNTLNQ9NXG0 1405 aa45.19■■■■■ 4.83
SYNGR1-202ENST00000318801 GGT6Q6P531 493 aa45.17■■■■■ 4.82
SYNGR1-202ENST00000318801 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
SYNGR1-202ENST00000318801 PPP6R1Q9UPN7 881 aa45.15■■■■■ 4.82
SYNGR1-202ENST00000318801 FGD6Q6ZV73 1430 aa45.13■■■■■ 4.82
SYNGR1-202ENST00000318801 PTPN23Q9H3S7 1636 aa45.13■■■■■ 4.82
SYNGR1-202ENST00000318801 KIF3BO15066 747 aa45.07■■■■■ 4.8
SYNGR1-202ENST00000318801 MAST1Q9Y2H9 1570 aa45.06■■■■■ 4.8
SYNGR1-202ENST00000318801 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
SYNGR1-202ENST00000318801 LMTK3Q96Q04 1460 aa45.01■■■■■ 4.8
SYNGR1-202ENST00000318801 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 C3P01024 1663 aa44.99■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 ZMYM3Q14202 1370 aa44.97■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 MROH2AA6NES4 1674 aa44.96■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 ABCC5O15440 1437 aa44.94■■■■■ 4.79
SYNGR1-202ENST00000318801 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.93■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 PREX1Q8TCU6 1659 aa44.92■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 DAPK1P53355 1430 aa44.91■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa44.88■■■■■ 4.78
SYNGR1-202ENST00000318801 HSPA2P54652 639 aa44.87■■■■■ 4.77
SYNGR1-202ENST00000318801 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.86■■■■■ 4.77
SYNGR1-202ENST00000318801 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.86■■■■■ 4.77
SYNGR1-202ENST00000318801 NPATQ14207 1427 aa44.84■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms