RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317483.4

RAB23-201, Transcript of RAB23, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB23, Length 2,546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23-201ENST00000317483 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.99□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.99□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 HFM1A2PYH4 1435 aa6.98□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.97□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.97□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 ATP10BO94823 1461 aa6.97□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 ABCC2Q92887 1545 aa6.97□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 KIF14Q15058 1648 aa6.97□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.96□□□□□ -1.29
RAB23-201ENST00000317483 HOMEZQ8IX15 550 aa6.96□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ROCK1Q13464 1354 aa6.96□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.96□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 PTPRGP23470 1445 aa6.95□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 UACAQ9BZF9 1416 aa6.95□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.95□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.95□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.95□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.94□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ADGRL2O95490 1459 aa6.94□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 MAPKBP1O60336 1514 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 NAIPQ13075 1403 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 PTPRKQ15262 1439 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 PREX2Q70Z35 1606 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 FBLN2P98095 1184 aa6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.92□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 DAPK1P53355 1430 aa6.91□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.91□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 MAST1Q9Y2H9 1570 aa6.91□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.91□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RAB23-201ENST00000317483 ABCC5O15440 1437 aa6.9□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.9□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.89□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.89□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.88□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 KLHL34Q8N239 644 aa6.88□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.87□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.87□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.86□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.86□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 MBD5Q9P267 1494 aa6.86□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 PLXNC1O60486 1568 aa6.86□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.86□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 PLEKHG5O94827 1062 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 NCOA1Q15788 1441 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.85□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 KDM6BO15054 1643 aa6.84□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.84□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RAB23-201ENST00000317483 PLCH2O75038 1416 aa6.84□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 KCNA4P22459 653 aa6.83□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.83□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.83□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ABCC1P33527 1531 aa6.82□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.82□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 HAX1O00165 279 aa6.82□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ITGAEP38570 1179 aa6.82□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 UNC13BO14795 1591 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 OSCARQ8IYS5 282 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 DSG3P32926 999 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.81□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 PZPP20742 1482 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa6.8□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 POTEMA6NI47 508 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.79□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ERBINQ96RT1 1412 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.78□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.77□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
RAB23-201ENST00000317483 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RAB23-201ENST00000317483 ARID3CA6NKF2 412 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms