RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308153.8

H2AFV-202, Transcript of H2A histone family member V, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2AFV, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFV-202ENST00000308153 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.88■■■■■ 5.1
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H2AFV-202ENST00000308153 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.83■■■■■ 5.09
H2AFV-202ENST00000308153 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.83■■■■■ 5.09
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H2AFV-202ENST00000308153 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.74■■■■■ 5.07
H2AFV-202ENST00000308153 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.72■■■■■ 5.07
H2AFV-202ENST00000308153 MADDQ8WXG6 1647 aa46.72■■■■■ 5.07
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H2AFV-202ENST00000308153 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa46.58■■■■■ 5.05
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H2AFV-202ENST00000308153 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.35■■■■■ 5.01
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H2AFV-202ENST00000308153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa45.88■■■■■ 4.94
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H2AFV-202ENST00000308153 A2MP01023 1474 aa45.86■■■■■ 4.93
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H2AFV-202ENST00000308153 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa45.73■■■■■ 4.91
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H2AFV-202ENST00000308153 ARHGEF5Q12774 1597 aa45.64■■■■■ 4.9
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H2AFV-202ENST00000308153 FBXO41Q8TF61 875 aa45.45■■■■■ 4.87
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H2AFV-202ENST00000308153 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45.35■■■■■ 4.85
H2AFV-202ENST00000308153 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.34■■■■■ 4.85
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H2AFV-202ENST00000308153 FAM135AQ9P2D6 1515 aa45.32■■■■■ 4.85
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H2AFV-202ENST00000308153 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
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