RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.96■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.95■■□□□ 1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM6BO15054 1643 aa23.95■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 PREX2Q70Z35 1606 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 NEO1Q92859 1461 aa23.93■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 AKNAQ7Z591 1439 aa23.92■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.89■■□□□ 1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.87■■□□□ 1.41
TSNARE1-201ENST00000307180 RAPGEF3O95398 923 aa23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRL1O94910 1474 aa23.86■■□□□ 1.41
TSNARE1-201ENST00000307180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.84■■□□□ 1.41
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.8■■□□□ 1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.79■■□□□ 1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.44e-6■■■■□ 20.8
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC1P33527 1531 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 AFAP1Q8N556 730 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 RICTORQ6R327 1708 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 MIA2Q96PC5 1412 aa23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.69■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.68■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.66■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 MBD5Q9P267 1494 aa23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM5CP41229 1560 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-201ENST00000307180 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.58■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.57■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.56■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPY4P0CV99 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 TSPY10P0CW01 314 aa23.55■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP7AQ04656 1500 aa23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA6Q8N139 1617 aa23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC5O15440 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ITGAEP38570 1179 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 DAPK1P53355 1430 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP10AO60312 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-201ENST00000307180 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 MLECQ14165 292 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.41■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.4■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.341e-9■■■□□ 18.2
TSNARE1-201ENST00000307180 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPRKQ15262 1439 aa23.39■■□□□ 1.34
TSNARE1-201ENST00000307180 A2MP01023 1474 aa23.38■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 MYT1Q01538 1121 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 REREQ9P2R6 1566 aa23.35■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 PLXNC1O60486 1568 aa23.33■■□□□ 1.33
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF15Q9NS87 1388 aa23.33■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 NCOA1Q15788 1441 aa23.31■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF3BO15066 747 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 AGLP35573 1532 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 GGT6Q6P531 493 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ADGRL2O95490 1459 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ROCK1Q13464 1354 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms