RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299179.9

MRPL43-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL43, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL43-201ENST00000299179 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPL43-201ENST00000299179 MADDQ8WXG6 1647 aa26.31■■□□□ 1.8
MRPL43-201ENST00000299179 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.3■■□□□ 1.8
MRPL43-201ENST00000299179 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.27■■□□□ 1.8
MRPL43-201ENST00000299179 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.26■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.26■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.25■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.25■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 MLECQ14165 292 aa26.23■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.22■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
MRPL43-201ENST00000299179 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.19■■□□□ 1.78
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.18■■□□□ 1.78
MRPL43-201ENST00000299179 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.16■■□□□ 1.78
MRPL43-201ENST00000299179 ATP10AO60312 1499 aa26.16■■□□□ 1.78
MRPL43-201ENST00000299179 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.15■■□□□ 1.78
MRPL43-201ENST00000299179 AFAP1Q8N556 730 aa26.12■■□□□ 1.77
MRPL43-201ENST00000299179 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.1■■□□□ 1.77
MRPL43-201ENST00000299179 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.1■■□□□ 1.77
MRPL43-201ENST00000299179 PREX2Q70Z35 1606 aa26.09■■□□□ 1.77
MRPL43-201ENST00000299179 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.08■■□□□ 1.76
MRPL43-201ENST00000299179 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.07■■□□□ 1.76
MRPL43-201ENST00000299179 KDM5CP41229 1560 aa26.06■■□□□ 1.76
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
MRPL43-201ENST00000299179 ABCC1P33527 1531 aa26.03■■□□□ 1.76
MRPL43-201ENST00000299179 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.01■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 HSPA2P54652 639 aa25.99■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.99■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.98■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.98■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.98■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.98■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.96■■□□□ 1.75
MRPL43-201ENST00000299179 ABCA6Q8N139 1617 aa25.95■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.94■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 REREQ9P2R6 1566 aa25.92■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.89■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 FBXO41Q8TF61 875 aa25.89■■□□□ 1.74
MRPL43-201ENST00000299179 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.88■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.87■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 CEP162Q5TB80 1403 aa25.87■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.87■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 AGLP35573 1532 aa25.86■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.84■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.84■■□□□ 1.73
MRPL43-201ENST00000299179 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.82■■□□□ 1.72
MRPL43-201ENST00000299179 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.81■■□□□ 1.72
MRPL43-201ENST00000299179 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.79■■□□□ 1.72
MRPL43-201ENST00000299179 ATP7AQ04656 1500 aa25.78■■□□□ 1.72
MRPL43-201ENST00000299179 C3P01024 1663 aa25.76■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.74■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 TIAM1Q13009 1591 aa25.73■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 A2MP01023 1474 aa25.71■■□□□ 1.71
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
MRPL43-201ENST00000299179 GGT6Q6P531 493 aa25.67■■□□□ 1.7
MRPL43-201ENST00000299179 CERKQ8TCT0 537 aa25.66■■□□□ 1.7
MRPL43-201ENST00000299179 ZMYM3Q14202 1370 aa25.64■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 NCOA2Q15596 1464 aa25.64■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 PLXNC1O60486 1568 aa25.64■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 MROH2AA6NES4 1674 aa25.64■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.63■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 NPATQ14207 1427 aa25.62■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.61■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 MBD5Q9P267 1494 aa25.6■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 STRCQ7RTU9 1775 aa25.59■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.59■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.59■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.58■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.58■■□□□ 1.69
MRPL43-201ENST00000299179 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.57■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.57■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 TSPY4P0CV99 314 aa25.53■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 TSPY10P0CW01 314 aa25.53■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 PTPRTO14522 1441 aa25.53■■□□□ 1.68
MRPL43-201ENST00000299179 KIF3BO15066 747 aa25.51■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 NCOA1Q15788 1441 aa25.51■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.51■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.5■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.48■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 PTPRKQ15262 1439 aa25.47■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 APLP2Q06481 763 aa25.46■■□□□ 1.67
MRPL43-201ENST00000299179 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.44■■□□□ 1.66
MRPL43-201ENST00000299179 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
MRPL43-201ENST00000299179 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.43■■□□□ 1.66
MRPL43-201ENST00000299179 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.42■■□□□ 1.66
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
MRPL43-201ENST00000299179 MAP3K1Q13233 1512 aa25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms