RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.23■■□□□ 1.95
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CCDC78-201ENST00000293889 FANCAO15360 1455 aa27.22■■□□□ 1.95
CCDC78-201ENST00000293889 NEO1Q92859 1461 aa27.21■■□□□ 1.95
CCDC78-201ENST00000293889 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.2■■□□□ 1.95
CCDC78-201ENST00000293889 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
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CCDC78-201ENST00000293889 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.12■■□□□ 1.93
CCDC78-201ENST00000293889 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.12■■□□□ 1.93
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CCDC78-201ENST00000293889 MBD5Q9P267 1494 aa26.93■■□□□ 1.9
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CCDC78-201ENST00000293889 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.91■■□□□ 1.9
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CCDC78-201ENST00000293889 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.84■■□□□ 1.89
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CCDC78-201ENST00000293889 TSPY10P0CW01 314 aa26.79■■□□□ 1.88
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CCDC78-201ENST00000293889 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.77■■□□□ 1.88
CCDC78-201ENST00000293889 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CCDC78-201ENST00000293889 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.76■■□□□ 1.87
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CCDC78-201ENST00000293889 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.73■■□□□ 1.87
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CCDC78-201ENST00000293889 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC78-201ENST00000293889 ROCK1Q13464 1354 aa26.71■■□□□ 1.87
CCDC78-201ENST00000293889 ADGRL2O95490 1459 aa26.7■■□□□ 1.87
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CCDC78-201ENST00000293889 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.7■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 NCOA1Q15788 1441 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 ATP10AO60312 1499 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC78-201ENST00000293889 HFM1A2PYH4 1435 aa26.65■■□□□ 1.86
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CCDC78-201ENST00000293889 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC78-201ENST00000293889 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC78-201ENST00000293889 AGLP35573 1532 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC78-201ENST00000293889 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC78-201ENST00000293889 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.48■■□□□ 1.83
CCDC78-201ENST00000293889 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CCDC78-201ENST00000293889 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC78-201ENST00000293889 ERBINQ96RT1 1412 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC78-201ENST00000293889 MLECQ14165 292 aa26.43■■□□□ 1.82
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