RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.65■□□□□ 0.9
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CCDC42-201ENST00000293845 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC42-201ENST00000293845 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC42-201ENST00000293845 AKNAQ7Z591 1439 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC42-201ENST00000293845 KDM6BO15054 1643 aa20.58■□□□□ 0.89
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CCDC42-201ENST00000293845 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC42-201ENST00000293845 MIA2Q96PC5 1412 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC42-201ENST00000293845 RICTORQ6R327 1708 aa20.53■□□□□ 0.88
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CCDC42-201ENST00000293845 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.42■□□□□ 0.86
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CCDC42-201ENST00000293845 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.38■□□□□ 0.85
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CCDC42-201ENST00000293845 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC42-201ENST00000293845 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.36■□□□□ 0.85
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CCDC42-201ENST00000293845 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC42-201ENST00000293845 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.34■□□□□ 0.85
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CCDC42-201ENST00000293845 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.33■□□□□ 0.84
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CCDC42-201ENST00000293845 PLXNC1O60486 1568 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC42-201ENST00000293845 REREQ9P2R6 1566 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC42-201ENST00000293845 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY4P0CV99 314 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC42-201ENST00000293845 TSPY10P0CW01 314 aa20.24■□□□□ 0.83
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CCDC42-201ENST00000293845 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.04■□□□□ 0.8
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CCDC42-201ENST00000293845 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCDC42-201ENST00000293845 HFM1A2PYH4 1435 aa20.02■□□□□ 0.8
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CCDC42-201ENST00000293845 NAIPQ13075 1403 aa20■□□□□ 0.79
CCDC42-201ENST00000293845 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20■□□□□ 0.79
CCDC42-201ENST00000293845 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.99■□□□□ 0.79
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CCDC42-201ENST00000293845 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.98■□□□□ 0.79
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