RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290377.9

TUBBP5-201, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TUBBP5, Length 1,563 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-201ENST00000290377 RICTORQ6R327 1708 aa24.64■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.63■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 PREX2Q70Z35 1606 aa24.63■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.62■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.6■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.59■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.58■■□□□ 1.53
TUBBP5-201ENST00000290377 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.57■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 TIAM1Q13009 1591 aa24.56■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.55■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.53■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.52■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.52■■□□□ 1.52
TUBBP5-201ENST00000290377 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.51■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 ABCC1P33527 1531 aa24.5■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 AFAP1Q8N556 730 aa24.5■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.5■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.48■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 APLP2Q06481 763 aa24.48■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.46■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 MAP3K1Q13233 1512 aa24.45■■□□□ 1.51
TUBBP5-201ENST00000290377 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.45■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.45■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 NCOA2Q15596 1464 aa24.45■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.45■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 KDM5CP41229 1560 aa24.44■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.41■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.41■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TUBBP5-201ENST00000290377 ATP10AO60312 1499 aa24.39■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.38■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.37■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.37■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.36■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.33■■□□□ 1.49
TUBBP5-201ENST00000290377 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.32■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.31■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 MLECQ14165 292 aa24.31■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 ABCA6Q8N139 1617 aa24.3■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.29■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.28■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 MADDQ8WXG6 1647 aa24.28■■□□□ 1.48
TUBBP5-201ENST00000290377 MBD5Q9P267 1494 aa24.26■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 ATP7AQ04656 1500 aa24.25■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 REREQ9P2R6 1566 aa24.25■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.24■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 PTPRMP28827 1452 aa24.24■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.21■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.21■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 MIA2Q96PC5 1412 aa24.21■■□□□ 1.47
TUBBP5-201ENST00000290377 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.18■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 AGLP35573 1532 aa24.18■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.16■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 TSPY4P0CV99 314 aa24.16■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 TSPY10P0CW01 314 aa24.16■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.16■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.16■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 A2MP01023 1474 aa24.14■■□□□ 1.46
TUBBP5-201ENST00000290377 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TUBBP5-201ENST00000290377 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.12■■□□□ 1.45
TUBBP5-201ENST00000290377 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.09■■□□□ 1.45
TUBBP5-201ENST00000290377 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.09■■□□□ 1.45
TUBBP5-201ENST00000290377 PLXNC1O60486 1568 aa24.08■■□□□ 1.45
TUBBP5-201ENST00000290377 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TUBBP5-201ENST00000290377 GGT6Q6P531 493 aa24.03■■□□□ 1.44
TUBBP5-201ENST00000290377 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TUBBP5-201ENST00000290377 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.02■■□□□ 1.44
TUBBP5-201ENST00000290377 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TUBBP5-201ENST00000290377 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 KIF3BO15066 747 aa23.99■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 ABCC5O15440 1437 aa23.97■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 DAPK1P53355 1430 aa23.97■■□□□ 1.43
TUBBP5-201ENST00000290377 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.95■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.95■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 C3P01024 1663 aa23.95■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.94■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.92■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 MROH2AA6NES4 1674 aa23.91■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 ZMYM3Q14202 1370 aa23.91■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.91■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.9■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 KIF15Q9NS87 1388 aa23.89■■□□□ 1.42
TUBBP5-201ENST00000290377 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.88■■□□□ 1.41
TUBBP5-201ENST00000290377 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.6 ms