RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 FMN1Q68DA7 1419 aa23.11■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.1■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.09■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.09■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 AKNAQ7Z591 1439 aa23.09■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.06■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.06■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.06■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 CRBNQ96SW2 442 aa23.02■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 NUP155O75694 1391 aa23.02■■□□□ 1.28
NOMO3-201ENST00000263012 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.99■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC7Q96M83 1385 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 BECN1Q14457 450 aa22.96■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 PRXQ9BXM0 1461 aa22.96■■□□□ 1.27
NOMO3-201ENST00000263012 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHG5O94827 1062 aa22.92■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 PANK3Q9H999 370 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 USP47Q96K76 1375 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 TMF1P82094 1093 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 NLRP13Q86W25 1043 aa22.89■■□□□ 1.26
NOMO3-201ENST00000263012 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 CUX1P39880 1505 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 ARID3AQ99856 593 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 RALBP1Q15311 655 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 UACAQ9BZF9 1416 aa22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 GSE1Q14687 1217 aa22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 COG6Q9Y2V7 657 aa22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA2Q08379 1002 aa22.77■■□□□ 1.24
NOMO3-201ENST00000263012 APBB1O00213 710 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 APAF1O14727 1248 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 CFTRP13569 1480 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 NFKBIBQ15653 356 aa22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 TOP2BQ02880 1626 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
NOMO3-201ENST00000263012 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 KIF15Q9NS87 1388 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 MORC1Q86VD1 984 aa22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.69■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 STK26Q9P289 416 aa22.68■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 NCOA2Q15596 1464 aa22.67■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 SOX12O15370 315 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 CDCA8Q53HL2 280 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 NESP48681 1621 aa22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 FAM161AQ3B820 660 aa22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 CFAP53Q96M91 514 aa22.64■■□□□ 1.22
NOMO3-201ENST00000263012 MAPKBP1O60336 1514 aa22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 PANK1Q8TE04 598 aa22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.62■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 PDE3BQ13370 1112 aa22.61■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 BACH2Q9BYV9 841 aa22.61■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 PLCB2Q00722 1185 aa22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 TIAM1Q13009 1591 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 NAIPQ13075 1403 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.58■■□□□ 1.21
NOMO3-201ENST00000263012 BCAR3O75815 825 aa22.58■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 GGT6Q6P531 493 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-201ENST00000263012 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms