RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262188.12

SMARCD3-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCD3, Length 1,993 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3-201ENST00000262188 PLCH2O75038 1416 aa41.95■■■■■ 4.31
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SMARCD3-201ENST00000262188 CD109Q6YHK3 1445 aa41.95■■■■■ 4.31
SMARCD3-201ENST00000262188 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.94■■■■■ 4.3
SMARCD3-201ENST00000262188 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.93■■■■■ 4.3
SMARCD3-201ENST00000262188 GLI2P10070 1586 aa41.93■■■■■ 4.3
SMARCD3-201ENST00000262188 MIA2Q96PC5 1412 aa41.91■■■■■ 4.3
SMARCD3-201ENST00000262188 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.88■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.87■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 ITGAEP38570 1179 aa41.85■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.84■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 TSPOAP1O95153 1857 aa41.82■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
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SMARCD3-201ENST00000262188 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.82■■■■■ 4.29
SMARCD3-201ENST00000262188 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.79■■■■■ 4.28
SMARCD3-201ENST00000262188 FANCAO15360 1455 aa41.79■■■■■ 4.28
SMARCD3-201ENST00000262188 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.75■■■■■ 4.27
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SMARCD3-201ENST00000262188 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
SMARCD3-201ENST00000262188 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.67■■■■■ 4.26
SMARCD3-201ENST00000262188 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
SMARCD3-201ENST00000262188 AKNAQ7Z591 1439 aa41.64■■■■■ 4.26
SMARCD3-201ENST00000262188 PTPRKQ15262 1439 aa41.63■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 ABCC1P33527 1531 aa41.62■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 MBD5Q9P267 1494 aa41.61■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 ADGRL1O94910 1474 aa41.6■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 ABCC5O15440 1437 aa41.58■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 DAPK1P53355 1430 aa41.57■■■■■ 4.25
SMARCD3-201ENST00000262188 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.57■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
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SMARCD3-201ENST00000262188 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.55■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 NEO1Q92859 1461 aa41.54■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.54■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 MYT1Q01538 1121 aa41.54■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.53■■■■■ 4.24
SMARCD3-201ENST00000262188 AFAP1Q8N556 730 aa41.5■■■■■ 4.23
SMARCD3-201ENST00000262188 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.5■■■■■ 4.23
SMARCD3-201ENST00000262188 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.48■■■■■ 4.23
SMARCD3-201ENST00000262188 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.46■■■■■ 4.23
SMARCD3-201ENST00000262188 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.44■■■■■ 4.22
SMARCD3-201ENST00000262188 RAPGEF3O95398 923 aa41.43■■■■■ 4.22
SMARCD3-201ENST00000262188 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.37■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.37■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 TSPY4P0CV99 314 aa41.36■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 TSPY10P0CW01 314 aa41.36■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.35■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.34■■■■■ 4.21
SMARCD3-201ENST00000262188 HRCP23327 699 aa41.31■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.29■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.29■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.27■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 RICTORQ6R327 1708 aa41.27■■■■■ 4.2
SMARCD3-201ENST00000262188 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.25■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.23■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 NCOA1Q15788 1441 aa41.22■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 KDM5CP41229 1560 aa41.21■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.21■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.2■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 ADGRL2O95490 1459 aa41.2■■■■■ 4.19
SMARCD3-201ENST00000262188 ROCK1Q13464 1354 aa41.19■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.19■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 NAIPQ13075 1403 aa41.18■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 ATP7AQ04656 1500 aa41.17■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 HFM1A2PYH4 1435 aa41.16■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.14■■■■■ 4.18
SMARCD3-201ENST00000262188 KIF15Q9NS87 1388 aa41.13■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.11■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.11■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 KDM6BO15054 1643 aa41.11■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.1■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.08■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.08■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.07■■■■■ 4.17
SMARCD3-201ENST00000262188 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.07■■■■■ 4.16
SMARCD3-201ENST00000262188 PLXNC1O60486 1568 aa41.07■■■■■ 4.16
SMARCD3-201ENST00000262188 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.03■■■■■ 4.16
SMARCD3-201ENST00000262188 ABCA6Q8N139 1617 aa41.02■■■■■ 4.16
SMARCD3-201ENST00000262188 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.98■■■■■ 4.15
SMARCD3-201ENST00000262188 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.95■■■■■ 4.15
SMARCD3-201ENST00000262188 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.92■■■■■ 4.14
SMARCD3-201ENST00000262188 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.88■■■■■ 4.13
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SMARCD3-201ENST00000262188 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
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SMARCD3-201ENST00000262188 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.8■■■■■ 4.12
SMARCD3-201ENST00000262188 TRIM52Q96A61 297 aa40.79■■■■■ 4.12
SMARCD3-201ENST00000262188 ATP10AO60312 1499 aa40.78■■■■■ 4.12
SMARCD3-201ENST00000262188 KIF3BO15066 747 aa40.77■■■■■ 4.12
SMARCD3-201ENST00000262188 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.74■■■■■ 4.11
SMARCD3-201ENST00000262188 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.74■■■■■ 4.11
SMARCD3-201ENST00000262188 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
SMARCD3-201ENST00000262188 NUP155O75694 1391 aa40.64■■■■■ 4.1
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